RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592965.2

MBD3-211, Transcript of methyl-CpG binding domain protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene MBD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3-211ENST00000592965 USP44Q9H0E7 712 aa29.29■■■□□ 2.28
MBD3-211ENST00000592965 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa29.29■■■□□ 2.28
MBD3-211ENST00000592965 MROH5Q6ZUA9 1318 aa29.28■■■□□ 2.28
MBD3-211ENST00000592965 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
MBD3-211ENST00000592965 ARAP2Q8WZ64 1704 aa29.28■■■□□ 2.28
MBD3-211ENST00000592965 SLC10A3P09131 477 aa29.27■■■□□ 2.28
MBD3-211ENST00000592965 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
MBD3-211ENST00000592965 MTMR14Q8NCE2 650 aa29.27■■■□□ 2.28
MBD3-211ENST00000592965 AKAP11Q9UKA4 1901 aa29.26■■■□□ 2.27
MBD3-211ENST00000592965 FAM205AQ6ZU69 1335 aa29.25■■■□□ 2.27
MBD3-211ENST00000592965 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
MBD3-211ENST00000592965 TSKSQ9UJT2 592 aa29.25■■■□□ 2.27
MBD3-211ENST00000592965 DLGAP5Q15398 846 aa29.24■■■□□ 2.27
MBD3-211ENST00000592965 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
MBD3-211ENST00000592965 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa29.23■■■□□ 2.27
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MBD3-211ENST00000592965 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa29.23■■■□□ 2.27
MBD3-211ENST00000592965 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
MBD3-211ENST00000592965 GYG1P46976 350 aa29.22■■■□□ 2.27
MBD3-211ENST00000592965 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
MBD3-211ENST00000592965 RASAL3Q86YV0 1011 aa29.22■■■□□ 2.27
MBD3-211ENST00000592965 NF2P35240 595 aa29.21■■■□□ 2.27
MBD3-211ENST00000592965 LRRC24Q50LG9 513 aa29.21■■■□□ 2.27
MBD3-211ENST00000592965 METTL24Q5JXM2 366 aa29.21■■■□□ 2.27
MBD3-211ENST00000592965 VGLL2Q8N8G2 317 aa29.21■■■□□ 2.27
MBD3-211ENST00000592965 JAG2Q9Y219 1238 aa29.21■■■□□ 2.27
MBD3-211ENST00000592965 MOB2Q70IA6 237 aa29.2■■■□□ 2.26
MBD3-211ENST00000592965 SAGE1Q9NXZ1 904 aa29.2■■■□□ 2.26
MBD3-211ENST00000592965 SPDYE2BA6NHP3 402 aa29.19■■■□□ 2.26
MBD3-211ENST00000592965 F8W031 263 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
MBD3-211ENST00000592965 SPDYE6P0CI01 402 aa29.19■■■□□ 2.26
MBD3-211ENST00000592965 CFAP100Q494V2 611 aa29.19■■■□□ 2.26
MBD3-211ENST00000592965 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
MBD3-211ENST00000592965 PDE8BO95263 885 aa29.18■■■□□ 2.26
MBD3-211ENST00000592965 MFSD14BQ5SR56 506 aa29.18■■■□□ 2.26
MBD3-211ENST00000592965 FBXO33Q7Z6M2 555 aa29.18■■■□□ 2.26
MBD3-211ENST00000592965 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
MBD3-211ENST00000592965 KLHDC4Q8TBB5 520 aa29.18■■■□□ 2.26
MBD3-211ENST00000592965 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
MBD3-211ENST00000592965 UBE2Q2LH0YL09 131 aa29.17■■■□□ 2.26
MBD3-211ENST00000592965 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
MBD3-211ENST00000592965 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa29.17■■■□□ 2.26
MBD3-211ENST00000592965 MYO1BO43795 1136 aa29.16■■■□□ 2.26
MBD3-211ENST00000592965 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
MBD3-211ENST00000592965 DEFB129Q9H1M3 183 aa29.16■■■□□ 2.26
MBD3-211ENST00000592965 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa29.16■■■□□ 2.26
MBD3-211ENST00000592965 RARSP54136 660 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
MBD3-211ENST00000592965 VPS37DQ86XT2 251 aa29.15■■■□□ 2.26
MBD3-211ENST00000592965 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
MBD3-211ENST00000592965 CSRNP1Q96S65 589 aa29.15■■■□□ 2.26
MBD3-211ENST00000592965 KIF16BQ96L93 1317 aa29.15■■■□□ 2.26
MBD3-211ENST00000592965 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
MBD3-211ENST00000592965 EYA2O00167 538 aa29.13■■■□□ 2.25
MBD3-211ENST00000592965 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
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MBD3-211ENST00000592965 ARMC9Q7Z3E5 817 aa29.13■■■□□ 2.25
MBD3-211ENST00000592965 ABHD8Q96I13 439 aa29.13■■■□□ 2.25
MBD3-211ENST00000592965 RNF186Q9NXI6 227 aa29.13■■■□□ 2.25
MBD3-211ENST00000592965 SERPINA10Q9UK55 444 aa29.13■■■□□ 2.25
MBD3-211ENST00000592965 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
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MBD3-211ENST00000592965 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
MBD3-211ENST00000592965 SSC5DA1L4H1 1573 aa29.12■■■□□ 2.25
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MBD3-211ENST00000592965 FGFR2P21802 821 aa29.11■■■□□ 2.25
MBD3-211ENST00000592965 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP29.11■■■□□ 2.25
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MBD3-211ENST00000592965 HDAC5Q9UQL6 1122 aa29.11■■■□□ 2.25
MBD3-211ENST00000592965 LDLRAD1Q5T700 205 aa29.1■■■□□ 2.25
MBD3-211ENST00000592965 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa29.1■■■□□ 2.25
MBD3-211ENST00000592965 FBXO3Q9UK99 471 aa29.1■■■□□ 2.25
MBD3-211ENST00000592965 TRPA1O75762 1119 aa29.09■■■□□ 2.25
MBD3-211ENST00000592965 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
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MBD3-211ENST00000592965 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
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MBD3-211ENST00000592965 ATG9AQ7Z3C6 839 aa29.08■■■□□ 2.25
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MBD3-211ENST00000592965 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
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MBD3-211ENST00000592965 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
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MBD3-211ENST00000592965 CRKP46108 304 aa29.06■■■□□ 2.24
MBD3-211ENST00000592965 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
MBD3-211ENST00000592965 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa29.06■■■□□ 2.24
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MBD3-211ENST00000592965 LAMB1P07942 1786 aa29.06■■■□□ 2.24
MBD3-211ENST00000592965 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
MBD3-211ENST00000592965 SLC5A1P13866 664 aa29.05■■■□□ 2.24
MBD3-211ENST00000592965 TNFAIP1Q13829 316 aa29.05■■■□□ 2.24
MBD3-211ENST00000592965 RASA3Q14644 834 aa29.05■■■□□ 2.24
MBD3-211ENST00000592965 GRIK5Q16478 980 aa29.05■■■□□ 2.24
MBD3-211ENST00000592965 MEIS3Q99687 375 aa29.05■■■□□ 2.24
MBD3-211ENST00000592965 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
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