RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591648.1

TPGS2-216, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 2, human

TSL 2

Gene TPGS2, Length 790 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPGS2-216	ENST00000591648	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
TPGS2-216	ENST00000591648	ZIC5	Q96T25	663 aa		32.33	■■■□□ 2.77
TPGS2-216	ENST00000591648	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
TPGS2-216	ENST00000591648	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
TPGS2-216	ENST00000591648	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
TPGS2-216	ENST00000591648	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
TPGS2-216	ENST00000591648	TSKS	Q9UJT2	592 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TPGS2-216	ENST00000591648	TNN	Q9UQP3	1299 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TPGS2-216	ENST00000591648	BCAR3	O75815	825 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TPGS2-216	ENST00000591648	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
TPGS2-216	ENST00000591648	MAP2K2	P36507	400 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TPGS2-216	ENST00000591648	RGMB	Q6NW40	437 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TPGS2-216	ENST00000591648	MOB2	Q70IA6	237 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TPGS2-216	ENST00000591648	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TPGS2-216	ENST00000591648	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
TPGS2-216	ENST00000591648	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
TPGS2-216	ENST00000591648	MEIS3	Q99687	375 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TPGS2-216	ENST00000591648	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
TPGS2-216	ENST00000591648	KIF16B	Q96L93	1317 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TPGS2-216	ENST00000591648	PDE8B	O95263	885 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TPGS2-216	ENST00000591648	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
TPGS2-216	ENST00000591648	DLGAP5	Q15398	846 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TPGS2-216	ENST00000591648	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
TPGS2-216	ENST00000591648	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TPGS2-216	ENST00000591648	SIL1	Q9H173	461 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TPGS2-216	ENST00000591648	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	VPS37D	Q86XT2	251 aa		32.26	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	CFAP100	Q494V2	611 aa		32.25	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	AOX1	Q06278	1338 aa		32.25	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		32.25	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	EYA2	O00167	538 aa		32.24	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	CAPN15	O75808	1086 aa		32.24	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	MMP14	P50281	582 aa		32.24	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		32.24	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		32.24	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		32.24	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	CLRN2	A0PK11	232 aa		32.23	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	BCAM	P50895	628 aa		32.23	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	32.23	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	NOG	Q13253	232 aa		32.23	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		32.23	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		32.22	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		32.22	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		32.21	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	TRIM27	P14373	513 aa		32.21	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	PRKG1	Q13976	671 aa		32.21	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	GRIK5	Q16478	980 aa		32.21	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		32.21	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
TPGS2-216	ENST00000591648	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TPGS2-216	ENST00000591648	SPDYE6	P0CI01	402 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TPGS2-216	ENST00000591648	FGFR2	P21802	821 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TPGS2-216	ENST00000591648	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TPGS2-216	ENST00000591648	CCDC102A	Q96A19	550 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TPGS2-216	ENST00000591648	FZD1	Q9UP38	647 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TPGS2-216	ENST00000591648	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		32.18	■■■□□ 2.74
TPGS2-216	ENST00000591648	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
TPGS2-216	ENST00000591648	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		32.18	■■■□□ 2.74
TPGS2-216	ENST00000591648	VEZT	Q9HBM0	779 aa		32.18	■■■□□ 2.74
TPGS2-216	ENST00000591648	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	32.17	■■■□□ 2.74
TPGS2-216	ENST00000591648	SLC10A3	P09131	477 aa		32.17	■■■□□ 2.74
TPGS2-216	ENST00000591648	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	32.17	■■■□□ 2.74
TPGS2-216	ENST00000591648	FKBP1B	P68106	108 aa		32.17	■■■□□ 2.74
TPGS2-216	ENST00000591648	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		32.17	■■■□□ 2.74
TPGS2-216	ENST00000591648	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		32.16	■■■□□ 2.74
TPGS2-216	ENST00000591648	NF2	P35240	595 aa		32.15	■■■□□ 2.74
TPGS2-216	ENST00000591648	MYO1B	O43795	1136 aa		32.14	■■■□□ 2.74
TPGS2-216	ENST00000591648	SLC5A1	P13866	664 aa		32.14	■■■□□ 2.74
TPGS2-216	ENST00000591648	GNAI3	P08754	354 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TPGS2-216	ENST00000591648	LPIN2	Q92539	896 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TPGS2-216	ENST00000591648	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
TPGS2-216	ENST00000591648	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TPGS2-216	ENST00000591648	CIAO1	O76071	339 aa		32.12	■■■□□ 2.73
TPGS2-216	ENST00000591648	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
TPGS2-216	ENST00000591648	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		32.12	■■■□□ 2.73
TPGS2-216	ENST00000591648	CRK	P46108	304 aa		32.11	■■■□□ 2.73
TPGS2-216	ENST00000591648	ATP2B3	Q16720	1220 aa		32.11	■■■□□ 2.73
TPGS2-216	ENST00000591648	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		32.11	■■■□□ 2.73
TPGS2-216	ENST00000591648	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		32.1	■■■□□ 2.73
TPGS2-216	ENST00000591648	SRGAP3	O43295	1099 aa		32.1	■■■□□ 2.73
TPGS2-216	ENST00000591648	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
TPGS2-216	ENST00000591648	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		32.1	■■■□□ 2.73
TPGS2-216	ENST00000591648	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		32.09	■■■□□ 2.73
TPGS2-216	ENST00000591648	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
TPGS2-216	ENST00000591648	CSRNP1	Q96S65	589 aa		32.09	■■■□□ 2.73
TPGS2-216	ENST00000591648	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
TPGS2-216	ENST00000591648	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
TPGS2-216	ENST00000591648	CA12	O43570	354 aa		32.08	■■■□□ 2.73
TPGS2-216	ENST00000591648	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
TPGS2-216	ENST00000591648	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		32.08	■■■□□ 2.73

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