RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 ZMYM6O95789 1325 aa8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 PXDNQ92626 1479 aa8.94□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 E7EWF7 191 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 CPLX1O14810 134 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 JAK2O60674 1132 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 GCP02774 474 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 STK3Q13188 491 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC144BQ3MJ40 725 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC93Q567U6 631 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 C14orf37Q86TY3 774 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 IFNL2Q8IZJ0 200 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 NCOA7Q8NI08 942 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF592Q92610 1267 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 USP28Q96RU2 1077 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP8.93□□□□□ -0.983e-7■■■□□ 15.9
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CAPNS1-202ENST00000586851 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 NRBP1Q9UHY1 535 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 TUBE1Q9UJT0 475 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 STK36Q9NRP7 1315 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 ATRNO75882 1429 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 ALS2Q96Q42 1657 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 NUP188Q5SRE5 1749 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 MYH7P12883 1935 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 DCCP43146 1447 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 STX10O60499 249 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 CUTAO60888 179 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 SLFN14P0C7P3 912 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 TFCP2Q12800 502 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 TRDNQ13061 729 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 SEMA3FQ13275 785 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 TRIM29Q14134 588 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC39A14Q15043 492 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP2R5BQ15173 497 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 MYSM1Q5VVJ2 828 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 ANKLE2Q86XL3 938 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC191Q8NCU4 936 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM87BQ96K49 555 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 PRDM10Q9NQV6 1147 aa8.92□□□□□ -0.98
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CAPNS1-202ENST00000586851 UBR2Q8IWV8 1755 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 CPDO75976 1380 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 NID2Q14112 1375 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 ERBB3P21860 1342 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 H7C1W4 665 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 SMC2O95347 1197 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 BMP15O95972 392 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 ANO1Q5XXA6 986 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM173BQ6P4H8 233 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 HOMER1Q86YM7 354 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 MPNDQ8N594 471 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 USHBP1Q8N6Y0 703 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 MLKLQ8NB16 471 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 XAGE3Q8WTP9 111 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 APPBP2Q92624 585 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 AK7Q96M32 723 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 MYD88Q99836 296 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 GBP3Q9H0R5 595 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 TMX1Q9H3N1 280 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 ACBD3Q9H3P7 528 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 PSD3Q9NYI0 1048 aa8.91□□□□□ -0.98
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CAPNS1-202ENST00000586851 CEP131Q9UPN4 1083 aa8.91□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 WDR17Q8IZU2 1322 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A087WZG4 1122 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 SPDYE4A6NLX3 237 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 EYA2O00167 538 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 SEMA3EO15041 775 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 KCNQ3O43525 872 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF202O95125 648 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 CTDNEP1O95476 244 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 TOP1P11387 765 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 MCM3P25205 808 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 SYKP43405 635 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 NT5C2P49902 561 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 FANCCQ00597 558 aa8.9□□□□□ -0.98
CAPNS1-202ENST00000586851 BRD3Q15059 726 aa8.9□□□□□ -0.98
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