RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579969.1

SNORD53-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 53, humanhuman

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Gene SNORD53, Length 78 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD53-201ENST00000579969 ELP3Q9H9T3 547 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 PODXL2Q9NZ53 605 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 KDM3BQ7LBC6 1761 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 MYPNQ86TC9 1320 aa3.23□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 LAMB4A4D0S4 1761 aa3.23□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 BDP1A6H8Y1 2624 aa3.23□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 BTBD19C9JJ37 291 aa3.23□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 ADCY3O60266 1144 aa3.23□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 UFL1O94874 794 aa3.23□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 NEFLP07196 543 aa3.23□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 MYL6BP14649 208 aa3.23□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 MRE11P49959 708 aa3.23□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 MAP3K9P80192 1104 aa3.23□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 ANKLE1Q8NAG6 615 aa3.23□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 USP38Q8NB14 1042 aa3.23□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 SLAIN1Q8ND83 568 aa3.23□□□□□ -1.89
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SNORD53-201ENST00000579969 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa3.23□□□□□ -1.89
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SNORD53-201ENST00000579969 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 ASB2Q96Q27 587 aa3.23□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 POLR3GLQ9BT43 218 aa3.23□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 EPHX3Q9H6B9 360 aa3.23□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa3.23□□□□□ -1.89
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SNORD53-201ENST00000579969 GGA1Q9UJY5 639 aa3.23□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 KIF20BQ96Q89 1820 aa3.23□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 FAM205AQ6ZU69 1335 aa3.22□□□□□ -1.89
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SNORD53-201ENST00000579969 INHAP05111 366 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 CETPP11597 493 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 ELNP15502 786 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 FLT3LGP49771 235 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 PRKCZQ05513 592 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 PDE3AQ14432 1141 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 DLGAP5Q15398 846 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 TMEM31Q5JXX7 168 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 DACT2Q5SW24 774 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 TTLL5Q6EMB2 1281 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 NLRP10Q86W26 655 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 IL27Q8NEV9 243 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 PXYLP1Q8TE99 480 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 PPM1EQ8WY54 764 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 FBXW7Q969H0 707 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 C11orf49Q9H6J7 331 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 MIS18AQ9NYP9 233 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 GABRQQ9UN88 632 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 CDH23Q9H251 3354 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 UBR2Q8IWV8 1755 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 SCN9AQ15858 1988 aa3.21□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 SH3TC1Q8TE82 1336 aa3.21□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 NUP98P52948 1817 aa3.21□□□□□ -1.89
SNORD53-201ENST00000579969 CLRN2A0PK11 232 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 GPR37L1O60883 481 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 FCGRTP55899 365 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 SNAPC2Q13487 334 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 RASA3Q14644 834 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 GRIN2CQ14957 1233 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 SHHQ15465 462 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 STRIP1Q5VSL9 837 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 MCM10Q7L590 875 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 KIAA0825Q8IV33 1275 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 MTMR14Q8NCE2 650 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF428Q96B54 188 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 PHACTR3Q96KR7 559 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 PANK3Q9H999 370 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 VEZTQ9HBM0 779 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 CSADQ9Y600 493 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 DUOX1Q9NRD9 1551 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 MYO3BQ8WXR4 1341 aa3.2□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 ADGRA2Q96PE1 1338 aa3.2□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 SMIM22K7EJ46 135 aa3.2□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 PDHXO00330 501 aa3.2□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 IRF6O14896 467 aa3.2□□□□□ -1.9
SNORD53-201ENST00000579969 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
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