RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576613.5

CTDNEP1-212, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTDNEP1, Length 606 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-212ENST00000576613 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-212ENST00000576613 TRIM17Q9Y577 477 aa14.86□□□□□ -0.03
CTDNEP1-212ENST00000576613 CACNA1FO60840 1977 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-212ENST00000576613 CASP7P55210 303 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-212ENST00000576613 CCDC27Q2M243 656 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-212ENST00000576613 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-212ENST00000576613 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-212ENST00000576613 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-212ENST00000576613 ZNF804AQ7Z570 1209 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-212ENST00000576613 DNAAF4Q8WXU2 420 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-212ENST00000576613 WNK4Q96J92 1243 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-212ENST00000576613 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-212ENST00000576613 FZD1Q9UP38 647 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-212ENST00000576613 HTTP42858 3142 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-212ENST00000576613 SSC5DA1L4H1 1573 aa14.85□□□□□ -0.03
CTDNEP1-212ENST00000576613 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-212ENST00000576613 SPDYE6P0CI01 402 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-212ENST00000576613 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-212ENST00000576613 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-212ENST00000576613 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-212ENST00000576613 CERS5Q8N5B7 392 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-212ENST00000576613 ERO1AQ96HE7 468 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-212ENST00000576613 CLMNQ96JQ2 1002 aa14.84□□□□□ -0.03
CTDNEP1-212ENST00000576613 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
CTDNEP1-212ENST00000576613 CLRN2A0PK11 232 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 F8W031 263 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 TAF5LO75529 589 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 IL1R1P14778 569 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 CFAP100Q494V2 611 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 VEZTQ9HBM0 779 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 IL16Q14005 1332 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.83□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 WWC1Q8IX03 1113 aa14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 CHMP3Q9Y3E7 222 aa14.82□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 SNAP23O00161 211 aa14.81□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 TNFAIP1Q13829 316 aa14.81□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa14.81□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 CENPFP49454 3210 aa14.81□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 OTOFQ9HC10 1997 aa14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 CRHR2Q13324 411 aa14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 RASA3Q14644 834 aa14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 CCDC57Q2TAC2 916 aa14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 TAF7LQ5H9L4 462 aa14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.8□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 FOXO4P98177 505 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 EFCC1Q9HA90 598 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 CNNM1Q9NRU3 951 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 POTEFA5A3E0 1075 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 USP2O75604 605 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 SP3Q02447 781 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 LMBR1LQ6UX01 489 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 JAG2Q9Y219 1238 aa14.78□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 FAM205AQ6ZU69 1335 aa14.77□□□□□ -0.04
CTDNEP1-212ENST00000576613 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 PLIN1O60240 522 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 GJA5P36382 358 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 ARHGEF6Q15052 776 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 MFSD14BQ5SR56 506 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 ARMC5Q96C12 935 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 OPTNQ96CV9 577 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 ELP3Q9H9T3 547 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 SERPINA10Q9UK55 444 aa14.77□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 AOX1Q06278 1338 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 GRM8O00222 908 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 TNNI2P48788 182 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 BEND3Q5T5X7 828 aa14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 BRCA2P51587 3418 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 F6X3S4 739 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 VAMP4O75379 141 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 PTPN18Q99952 460 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 GTF2A2P52657 109 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 UBE4AQ14139 1066 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 NBPF11Q86T75 865 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa14.74□□□□□ -0.05
CTDNEP1-212ENST00000576613 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms