RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
CCNDBP1-211ENST00000567434 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.33■■□□□ 1.01
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
CCNDBP1-211ENST00000567434 SAPCD2Q86UD0 394 aa21.33■■□□□ 1.01
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIAA0825Q8IV33 1275 aa21.33■■□□□ 1.01
CCNDBP1-211ENST00000567434 GYG1P46976 350 aa21.32■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 FBXO33Q7Z6M2 555 aa21.32■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 VPS37DQ86XT2 251 aa21.32■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.32■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADM5C9JUS6 153 aa21.31■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 WNT10BO00744 389 aa21.31■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 LBX1P52954 281 aa21.31■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 MTX1Q13505 466 aa21.31■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 FGFR2P21802 821 aa21.3■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATG9AQ7Z3C6 839 aa21.3■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 CERS5Q8N5B7 392 aa21.3■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.3■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.3■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 COPRSQ9NQ92 184 aa21.3■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 GNAI2P04899 355 aa21.29■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 NBPF9Q3BBW0 867 aa21.29■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 C2orf69Q8N8R5 385 aa21.29■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 LPIN2Q92539 896 aa21.29■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 CAPNS2Q96L46 248 aa21.29■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.29■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC5A1P13866 664 aa21.28■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 DLGAP5Q15398 846 aa21.28■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.28■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDCA5Q96FF9 252 aa21.28■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 CEP126Q9P2H0 1117 aa21.28■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.28■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.27■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 SIL1Q9H173 461 aa21.27■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 TNNQ9UQP3 1299 aa21.27■■□□□ 1
CCNDBP1-211ENST00000567434 SRGAP3O43295 1099 aa21.26■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 FKBP1BP68106 108 aa21.26■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.26■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYO1BO43795 1136 aa21.25■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAP2K2P36507 400 aa21.25■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 HUNKP57058 714 aa21.25■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 CYP4F22Q6NT55 531 aa21.25■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 BCAMP50895 628 aa21.24■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATP2B3Q16720 1220 aa21.24■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 DLK2Q6UY11 383 aa21.24■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 SERPINA10Q9UK55 444 aa21.24■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 JAG2Q9Y219 1238 aa21.24■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.23■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.23■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 F8W031 263 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPDYE6P0CI01 402 aa21.23■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 MS4A1P11836 297 aa21.23■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 CFAP100Q494V2 611 aa21.23■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.23■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa21.23■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZBTB22O15209 634 aa21.22■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 NF2P35240 595 aa21.22■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.22■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 NOGQ13253 232 aa21.21■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 RGMBQ6NW40 437 aa21.21■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.21■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 BEGAINQ9BUH8 593 aa21.21■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.21■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAST3O60307 1309 aa21.21■□□□□ 0.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 SEMA3EO15041 775 aa21.2■□□□□ 0.98
CCNDBP1-211ENST00000567434 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.2■□□□□ 0.98
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
CCNDBP1-211ENST00000567434 GRM1Q13255 1194 aa21.2■□□□□ 0.98
CCNDBP1-211ENST00000567434 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.2■□□□□ 0.98
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC102AQ96A19 550 aa21.2■□□□□ 0.98
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABHD8Q96I13 439 aa21.2■□□□□ 0.98
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CCNDBP1-211ENST00000567434 MRIQ9BWK5 157 aa21.19■□□□□ 0.98
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.18■□□□□ 0.98
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
CCNDBP1-211ENST00000567434 RLBP1P12271 317 aa21.18■□□□□ 0.98
CCNDBP1-211ENST00000567434 DEFB129Q9H1M3 183 aa21.18■□□□□ 0.98
CCNDBP1-211ENST00000567434 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa21.17■□□□□ 0.98
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
CCNDBP1-211ENST00000567434 TNFAIP1Q13829 316 aa21.17■□□□□ 0.98
CCNDBP1-211ENST00000567434 CA12O43570 354 aa21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms