RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553277.5

LRP1-204, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP1, Length 1,693 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-204ENST00000553277 SCARF1Q14162 830 aa22.35■■□□□ 1.17
LRP1-204ENST00000553277 SLC51AQ86UW1 340 aa22.35■■□□□ 1.17
LRP1-204ENST00000553277 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
LRP1-204ENST00000553277 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
LRP1-204ENST00000553277 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.35■■□□□ 1.17
LRP1-204ENST00000553277 HIP1O00291 1037 aa22.34■■□□□ 1.17
LRP1-204ENST00000553277 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
LRP1-204ENST00000553277 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
LRP1-204ENST00000553277 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.34■■□□□ 1.17
LRP1-204ENST00000553277 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.34■■□□□ 1.17
LRP1-204ENST00000553277 KCNJ4P48050 445 aa22.33■■□□□ 1.17
LRP1-204ENST00000553277 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.33■■□□□ 1.17
LRP1-204ENST00000553277 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.33■■□□□ 1.17
LRP1-204ENST00000553277 GGA1Q9UJY5 639 aa22.33■■□□□ 1.17
LRP1-204ENST00000553277 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
LRP1-204ENST00000553277 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.33■■□□□ 1.17
LRP1-204ENST00000553277 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.33■■□□□ 1.17
LRP1-204ENST00000553277 SEMA3EO15041 775 aa22.33■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.33■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 KCNB2Q92953 911 aa22.33■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 SNRKQ9NRH2 765 aa22.33■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 SNED1Q8TER0 1413 aa22.33■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 RASGRF1Q13972 1273 aa22.32■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.32■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.32■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.32■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 POLLQ9UGP5 575 aa22.32■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.31■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 KLRK1P26718 216 aa22.31■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 GYG1P46976 350 aa22.31■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.31■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 IL25Q9H293 177 aa22.31■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 MED23Q9ULK4 1368 aa22.3■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 BRD1O95696 1058 aa22.3■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 DPEP1P16444 411 aa22.3■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 ZAP70P43403 619 aa22.3■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.3■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 TTLL6Q8N841 843 aa22.3■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 SPATA5Q8NB90 893 aa22.3■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.3■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.3■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 GOLIM4O00461 696 aa22.3■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 UFL1O94874 794 aa22.3■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 MCTP1Q6DN14 999 aa22.3■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 MPNDQ8N594 471 aa22.3■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.3■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.3■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 CACNA1SQ13698 1873 aa22.29■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 A0A0G2JLW4 131 aa22.29■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 ZNF445P59923 1031 aa22.29■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 PI16Q6UXB8 463 aa22.29■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 PKP1Q13835 747 aa22.28■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 TTC14Q96N46 770 aa22.28■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 FSD1Q9BTV5 496 aa22.28■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 SPON1Q9HCB6 807 aa22.28■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.27■■□□□ 1.16
LRP1-204ENST00000553277 OLFM4Q6UX06 510 aa22.26■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 VPS37DQ86XT2 251 aa22.26■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 IL1R1P14778 569 aa22.26■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 DOCK2Q92608 1830 aa22.26■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 IGSF3O75054 1194 aa22.25■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.25■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 PIM2Q9P1W9 311 aa22.25■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 MYH7P12883 1935 aa22.24■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 C6orf229H3BNL8 230 aa22.23■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 MBD3O95983 291 aa22.23■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.23■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.23■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 CD209Q9NNX6 404 aa22.23■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.22■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.22■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 SOGA3Q5TF21 947 aa22.22■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 VPS53Q5VIR6 699 aa22.22■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.22■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 EYA3Q99504 573 aa22.22■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 COA1Q9GZY4 146 aa22.22■■□□□ 1.15
LRP1-204ENST00000553277 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.22■■□□□ 1.15
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