RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516099.1

RNU6-491P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 491, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-491P, Length 110 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-491P-201ENST00000516099 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RNU6-491P-201ENST00000516099 NXPE3Q969Y0 559 aa8.34□□□□□ -1.07
RNU6-491P-201ENST00000516099 EFCC1Q9HA90 598 aa8.34□□□□□ -1.07
RNU6-491P-201ENST00000516099 LRRC4BQ9NT99 713 aa8.34□□□□□ -1.07
RNU6-491P-201ENST00000516099 A0A096LPE4 126 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 A0A1W2PPZ6 126 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 NFKBIEO00221 500 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 FGFR3P22607 806 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 NRLP54845 237 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 SIK1P57059 783 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 FBXL19Q6PCT2 694 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 PHC3Q8NDX5 983 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 RASGRP4Q8TDF6 673 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 ANKRD24Q8TF21 1146 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 RASSF4Q9H2L5 321 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 PF4P02776 101 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 ITGB2P05107 769 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 RLBP1P12271 317 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 MAP2K3P46734 347 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 NASPP49321 788 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 LIG3P49916 1009 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 ATP11AP98196 1134 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 NEUROD1Q13562 356 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 CEP44Q9C0F1 390 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 SEC31BQ9NQW1 1179 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 KLF15Q9UIH9 416 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 PRR12Q9ULL5 1215 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 EFR3BQ9Y2G0 817 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 CADPSQ9ULU8 1353 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 ENC1O14682 589 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 ITPKAP23677 461 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 TRPM4Q8TD43 1214 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 SEC16BQ96JE7 1060 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 RHOVQ96L33 236 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 PBX4Q9BYU1 374 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 GINM1Q9NU53 330 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 PHF24Q9UPV7 400 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 PAGE1O75459 146 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 GHRHP01286 108 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 GPLD1P80108 840 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 FAAP100Q0VG06 881 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 SOGA3Q5TF21 947 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 GALNT6Q8NCL4 622 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 ZNF576Q9H609 170 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 PIF1Q9H611 641 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 ENAMQ9NRM1 1142 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 GARTP22102 1010 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 SNAP47Q5SQN1 464 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 FAM182BQ5T319 152 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 TTBK2Q6IQ55 1244 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 SYT9Q86SS6 491 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 GOLM1Q8NBJ4 401 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 NT5C1AQ9BXI3 368 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 MUC3BQ9H195 1237 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 UBP1Q9NZI7 540 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 MRVI1Q9Y6F6 885 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 GREM1O60565 184 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 BMP4P12644 408 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 CEP135Q66GS9 1140 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 KANK3Q6NY19 840 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 NEDD1Q8NHV4 660 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 EDARADDQ8WWZ3 215 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 GGA1Q9UJY5 639 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU6-491P-201ENST00000516099 CANXP27824 592 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 LMNB2Q03252 620 aa8.27□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 PCNX4Q63HM2 1172 aa8.27□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 AGMOQ6ZNB7 445 aa8.27□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 CKAP2LQ8IYA6 745 aa8.27□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 RBSNQ9H1K0 784 aa8.27□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 OSBPL2Q9H1P3 480 aa8.27□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 ZNF408Q9H9D4 720 aa8.27□□□□□ -1.09
RNU6-491P-201ENST00000516099 KCNQ5Q9NR82 932 aa8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms