RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496465.1

TM2D1-211, Transcript of TM2 domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TM2D1, Length 577 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1-211ENST00000496465 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TM2D1-211ENST00000496465 ZIC5Q96T25 663 aa22.9■■□□□ 1.26
TM2D1-211ENST00000496465 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TM2D1-211ENST00000496465 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.9■■□□□ 1.26
TM2D1-211ENST00000496465 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.89■■□□□ 1.26
TM2D1-211ENST00000496465 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.89■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.88■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 SLC10A3P09131 477 aa22.87■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 LRRC24Q50LG9 513 aa22.87■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.87■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 GYG1P46976 350 aa22.86■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 DLGAP5Q15398 846 aa22.86■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.86■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.86■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 CAPN15O75808 1086 aa22.84■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 PDE8BO95263 885 aa22.84■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 METTL24Q5JXM2 366 aa22.84■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.84■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 TSKSQ9UJT2 592 aa22.84■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 JAG2Q9Y219 1238 aa22.84■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 F8W031 263 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 NF2P35240 595 aa22.83■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 MOB2Q70IA6 237 aa22.83■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.83■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.83■■□□□ 1.25
TM2D1-211ENST00000496465 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.82■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 SPDYE6P0CI01 402 aa22.82■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 CFAP100Q494V2 611 aa22.82■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.82■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.82■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.81■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.81■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.81■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.81■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 KIF16BQ96L93 1317 aa22.81■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.8■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 EYA2O00167 538 aa22.8■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 MYO1BO43795 1136 aa22.8■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.8■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 CSRNP1Q96S65 589 aa22.8■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.8■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 FGFR2P21802 821 aa22.79■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 VPS37DQ86XT2 251 aa22.79■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.79■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.79■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 FBXO3Q9UK99 471 aa22.78■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.77■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.77■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 RNF186Q9NXI6 227 aa22.77■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 AOX1Q06278 1338 aa22.77■■□□□ 1.24
TM2D1-211ENST00000496465 CLRN2A0PK11 232 aa22.76■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 BCAMP50895 628 aa22.76■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.76■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.76■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 CIAO1O76071 339 aa22.75■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 MIER1Q8N108 512 aa22.75■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.75■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 LAMB1P07942 1786 aa22.74■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 TRPA1O75762 1119 aa22.74■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 MAP3K11Q16584 847 aa22.74■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.74■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 LPIN2Q92539 896 aa22.74■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 ABHD8Q96I13 439 aa22.74■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 MEIS3Q99687 375 aa22.74■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 CRKP46108 304 aa22.73■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 PRKG1Q13976 671 aa22.73■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 GRIK5Q16478 980 aa22.73■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.73■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 VEZTQ9HBM0 779 aa22.73■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 SLC5A1P13866 664 aa22.72■■□□□ 1.23
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