RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482110.5

PBX1-208, Transcript of PBX homeobox 1, human

TSL 5

Gene PBX1, Length 572 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PBX1-208	ENST00000482110	SCARF1	Q14162	830 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PBX1-208	ENST00000482110	ATP2B3	Q16720	1220 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PBX1-208	ENST00000482110	CERS5	Q8N5B7	392 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PBX1-208	ENST00000482110	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
PBX1-208	ENST00000482110	GGA3	Q9NZ52	723 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PBX1-208	ENST00000482110	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
PBX1-208	ENST00000482110	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PBX1-208	ENST00000482110	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PBX1-208	ENST00000482110	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PBX1-208	ENST00000482110	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
PBX1-208	ENST00000482110	SULF1	Q8IWU6	871 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PBX1-208	ENST00000482110	BCAM	P50895	628 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PBX1-208	ENST00000482110	ATP8B2	P98198	1209 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PBX1-208	ENST00000482110	POLA2	Q14181	598 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PBX1-208	ENST00000482110	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PBX1-208	ENST00000482110	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PBX1-208	ENST00000482110	USP48	Q86UV5	1035 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PBX1-208	ENST00000482110	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PBX1-208	ENST00000482110	JAG2	Q9Y219	1238 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PBX1-208	ENST00000482110	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PBX1-208	ENST00000482110	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PBX1-208	ENST00000482110	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
PBX1-208	ENST00000482110	SSH3	Q8TE77	659 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PBX1-208	ENST00000482110	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
PBX1-208	ENST00000482110	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PBX1-208	ENST00000482110	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PBX1-208	ENST00000482110	CNTNAP1	P78357	1384 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	WNT10B	O00744	389 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	27.88	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	27.88	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	CST9	Q5W186	159 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	PDE3A	Q14432	1141 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	DLGAP5	Q15398	846 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	RASSF10	A6NK89	507 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	ADM5	C9JUS6	153 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110		F8W031	263 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	TFCP2	Q12800	502 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	JMY	Q8N9B5	988 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	ZBTB22	O15209	634 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	COG6	Q9Y2V7	657 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	SEMA3E	O15041	775 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	CEP85	Q6P2H3	762 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PBX1-208	ENST00000482110		A0A1B0GUL7	405 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	CFAP100	Q494V2	611 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	MYO1B	O43795	1136 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	SPDYE6	P0CI01	402 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	CDCA5	Q96FF9	252 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	MAST3	O60307	1309 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	ADORA1	P30542	326 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	PHKA1	P46020	1223 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	27.79	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	TIMM10	P62072	90 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	CCDC102B	Q68D86	513 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	XAGE2	Q96GT9	111 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	GPR108	Q9NPR9	543 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	DLK2	Q6UY11	383 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	MRI	Q9BWK5	157 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
PBX1-208	ENST00000482110	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	ECE1	P42892	770 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	VEGFB	P49765	207 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	CRK	P46108	304 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	HMMR	O75330	724 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PBX1-208	ENST00000482110	FKBP1B	P68106	108 aa		27.74	■■■□□ 2.03

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