RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 SCARF1Q14162 830 aa20.44■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 ATP2B3Q16720 1220 aa20.44■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.44■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.44■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 COG6Q9Y2V7 657 aa20.44■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 TMEM88BA6NKF7 163 aa20.43■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 VPS37DQ86XT2 251 aa20.43■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 KIAA0825Q8IV33 1275 aa20.43■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.43■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 HDAC9Q9UKV0 1011 aa20.43■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 TFCP2Q12800 502 aa20.42■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 CST9Q5W186 159 aa20.42■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 CEP85Q6P2H3 762 aa20.42■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.42■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 TRAF5O00463 557 aa20.41■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 WNT10BO00744 389 aa20.41■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 TIMM10P62072 90 aa20.41■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 C20orf194Q5TEA3 1177 aa20.41■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.41■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 NBPF9Q3BBW0 867 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 USP48Q86UV5 1035 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 KLRG1Q96E93 195 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4B-216ENST00000475195 KRT26Q7Z3Y9 468 aa20.39■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 MRIQ9BWK5 157 aa20.39■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 GPR108Q9NPR9 543 aa20.39■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 JAG2Q9Y219 1238 aa20.39■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 TRPM7Q96QT4 1865 aa20.39■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 A0A1B0GUL7 405 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 GGA3Q9NZ52 723 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 SEMA3EO15041 775 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 CCDC102BQ68D86 513 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 XAGE2Q96GT9 111 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 SERPINA10Q9UK55 444 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 ARAP2Q8WZ64 1704 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 ADORA1P30542 326 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 PHKA1P46020 1223 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 DLGAP5Q15398 846 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 GRIK5Q16478 980 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 SULF1Q8IWU6 871 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 SIRT2Q8IXJ6 389 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 JMYQ8N9B5 988 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 RASSF10A6NK89 507 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 DLK2Q6UY11 383 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 SALL1Q9NSC2 1324 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 F8W031 263 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 CELF2O95319 508 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 SPDYE6P0CI01 402 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 CFAP100Q494V2 611 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 ADM5C9JUS6 153 aa20.33■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 DEFB115Q30KQ5 88 aa20.33■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.33■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.33■□□□□ 0.85
ATG4B-216ENST00000475195 CNTNAP1P78357 1384 aa20.33■□□□□ 0.84
ATG4B-216ENST00000475195 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-216ENST00000475195 TNNI3KQ59H18 835 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-216ENST00000475195 SAPCD2Q86UD0 394 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-216ENST00000475195 HHIPL1Q96JK4 782 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-216ENST00000475195 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa20.32■□□□□ 0.84
ATG4B-216ENST00000475195 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-216ENST00000475195 CDCA5Q96FF9 252 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-216ENST00000475195 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-216ENST00000475195 ECM29Q5VYK3 1845 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-216ENST00000475195 HMMRO75330 724 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-216ENST00000475195 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-216ENST00000475195 CRKP46108 304 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-216ENST00000475195 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-216ENST00000475195 RASGRF1Q13972 1273 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-216ENST00000475195 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-216ENST00000475195 HHIPL2Q6UWX4 724 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-216ENST00000475195 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms