RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 NT5C1AQ9BXI3 368 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 SEC31BQ9NQW1 1179 aa7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 CDC14CA4D256 554 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 GPR25O00155 361 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 PPFIA3O75145 1194 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7.04□□□□□ -1.288e-15■■■■□ 24
RABGGTB-207ENST00000470201 GARTP22102 1010 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 CANXP27824 592 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 RPS26P62854 115 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 LMNB2Q03252 620 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 FAAP100Q0VG06 881 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 TTBK2Q6IQ55 1244 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 HFE2Q6ZVN8 426 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 SV2AQ7L0J3 742 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 TNFRSF25Q93038 417 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 IGFLR1Q9H665 355 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 BMP4P12644 408 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 FBXL19Q6PCT2 694 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 AGMOQ6ZNB7 445 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 BSNDQ8WZ55 320 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 MUC3BQ9H195 1237 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM39AQ9NV64 488 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 STRIP2Q9ULQ0 834 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 TLR6Q9Y2C9 796 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-207ENST00000470201 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 GREM1O60565 184 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 PF4P02776 101 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 SOX9P48436 509 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 NASPP49321 788 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM160A1Q05DH4 1040 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP2R3AQ06190 1150 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 PCNX4Q63HM2 1172 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 CEP135Q66GS9 1140 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 VWA5B2Q8N398 1253 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC6A14Q9UN76 642 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 SAMM50Q9Y512 469 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 C2CD2LO14523 706 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 PAGE1O75459 146 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 CPB1P15086 417 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 PTPRAP18433 802 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC144BQ3MJ40 725 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM35AQ86V20 835 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.01□□□□□ -1.29
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RABGGTB-207ENST00000470201 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 GOLM1Q8NBJ4 401 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 PLD4Q96BZ4 506 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 GINM1Q9NU53 330 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 SOX13Q9UN79 622 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM181BA6NEQ2 426 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 B3GALT4O96024 378 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 ARAFP10398 606 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 MX2P20592 715 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 ADH7P40394 386 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 PCDH1Q08174 1060 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 NBPF6Q5VWK0 638 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM196AQ6ZSG2 479 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 NBPF4Q96M43 638 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 LRRC3Q9BY71 257 aa7□□□□□ -1.29
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RABGGTB-207ENST00000470201 OSBPL2Q9H1P3 480 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 NAGPAQ9UK23 515 aa7□□□□□ -1.29
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RABGGTB-207ENST00000470201 VSIG8P0DPA2 414 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 LMNB1P20700 586 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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RABGGTB-207ENST00000470201 APOBRQ0VD83 1088 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 PERM1Q5SV97 790 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.99□□□□□ -1.29
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RABGGTB-207ENST00000470201 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 CKAP2LQ8IYA6 745 aa6.99□□□□□ -1.29
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RABGGTB-207ENST00000470201 MDFIQ99750 246 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 UBP1Q9NZI7 540 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM177BA6PVY3 158 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 NME2P22392 152 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-207ENST00000470201 SLITRK4Q8IW52 837 aa6.98□□□□□ -1.29
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