RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.37■■□□□ 1.65
HLA-B-250ENST00000434333 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
HLA-B-250ENST00000434333 UBE4AQ14139 1066 aa25.36■■□□□ 1.65
HLA-B-250ENST00000434333 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.36■■□□□ 1.65
HLA-B-250ENST00000434333 ECM29Q5VYK3 1845 aa25.35■■□□□ 1.65
HLA-B-250ENST00000434333 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa25.35■■□□□ 1.65
HLA-B-250ENST00000434333 MTMR14Q8NCE2 650 aa25.35■■□□□ 1.65
HLA-B-250ENST00000434333 USP44Q9H0E7 712 aa25.35■■□□□ 1.65
HLA-B-250ENST00000434333 JAG2Q9Y219 1238 aa25.35■■□□□ 1.65
HLA-B-250ENST00000434333 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa25.35■■□□□ 1.65
HLA-B-250ENST00000434333 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
HLA-B-250ENST00000434333 ABHD8Q96I13 439 aa25.34■■□□□ 1.65
HLA-B-250ENST00000434333 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.33■■□□□ 1.65
HLA-B-250ENST00000434333 CCER2I3L3R5 266 aa25.33■■□□□ 1.65
HLA-B-250ENST00000434333 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
HLA-B-250ENST00000434333 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
HLA-B-250ENST00000434333 CSRNP1Q96S65 589 aa25.33■■□□□ 1.65
HLA-B-250ENST00000434333 FAM205AQ6ZU69 1335 aa25.33■■□□□ 1.64
HLA-B-250ENST00000434333 F8W031 263 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
HLA-B-250ENST00000434333 GYG1P46976 350 aa25.32■■□□□ 1.64
HLA-B-250ENST00000434333 DLGAP5Q15398 846 aa25.32■■□□□ 1.64
HLA-B-250ENST00000434333 LRRC24Q50LG9 513 aa25.32■■□□□ 1.64
HLA-B-250ENST00000434333 SAGE1Q9NXZ1 904 aa25.32■■□□□ 1.64
HLA-B-250ENST00000434333 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25.32■■□□□ 1.64
HLA-B-250ENST00000434333 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.32■■□□□ 1.64
HLA-B-250ENST00000434333 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.31■■□□□ 1.64
HLA-B-250ENST00000434333 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
HLA-B-250ENST00000434333 AOX1Q06278 1338 aa25.31■■□□□ 1.64
HLA-B-250ENST00000434333 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.3■■□□□ 1.64
HLA-B-250ENST00000434333 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
HLA-B-250ENST00000434333 CFAP100Q494V2 611 aa25.3■■□□□ 1.64
HLA-B-250ENST00000434333 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.3■■□□□ 1.64
HLA-B-250ENST00000434333 RNF186Q9NXI6 227 aa25.3■■□□□ 1.64
HLA-B-250ENST00000434333 SPDYE2BA6NHP3 402 aa25.29■■□□□ 1.64
HLA-B-250ENST00000434333 SPDYE6P0CI01 402 aa25.29■■□□□ 1.64
HLA-B-250ENST00000434333 KLHDC4Q8TBB5 520 aa25.29■■□□□ 1.64
HLA-B-250ENST00000434333 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
HLA-B-250ENST00000434333 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.28■■□□□ 1.64
HLA-B-250ENST00000434333 NF2P35240 595 aa25.28■■□□□ 1.64
HLA-B-250ENST00000434333 DEFB129Q9H1M3 183 aa25.28■■□□□ 1.64
HLA-B-250ENST00000434333 TRPA1O75762 1119 aa25.27■■□□□ 1.64
HLA-B-250ENST00000434333 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
HLA-B-250ENST00000434333 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
HLA-B-250ENST00000434333 FBXO33Q7Z6M2 555 aa25.27■■□□□ 1.64
HLA-B-250ENST00000434333 CLRN2A0PK11 232 aa25.26■■□□□ 1.63
HLA-B-250ENST00000434333 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
HLA-B-250ENST00000434333 METTL24Q5JXM2 366 aa25.26■■□□□ 1.63
HLA-B-250ENST00000434333 MFSD14BQ5SR56 506 aa25.26■■□□□ 1.63
HLA-B-250ENST00000434333 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
HLA-B-250ENST00000434333 PDE8BO95263 885 aa25.25■■□□□ 1.63
HLA-B-250ENST00000434333 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
HLA-B-250ENST00000434333 LDLRAD1Q5T700 205 aa25.25■■□□□ 1.63
HLA-B-250ENST00000434333 MCOLN1Q9GZU1 580 aa25.25■■□□□ 1.63
HLA-B-250ENST00000434333 FZD1Q9UP38 647 aa25.25■■□□□ 1.63
HLA-B-250ENST00000434333 PRKG1Q13976 671 aa25.24■■□□□ 1.63
HLA-B-250ENST00000434333 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa25.24■■□□□ 1.63
HLA-B-250ENST00000434333 GRIK5Q16478 980 aa25.23■■□□□ 1.63
HLA-B-250ENST00000434333 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.23■■□□□ 1.63
HLA-B-250ENST00000434333 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
HLA-B-250ENST00000434333 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
HLA-B-250ENST00000434333 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
HLA-B-250ENST00000434333 MYO1BO43795 1136 aa25.22■■□□□ 1.63
HLA-B-250ENST00000434333 FGFR2P21802 821 aa25.22■■□□□ 1.63
HLA-B-250ENST00000434333 MAP3K11Q16584 847 aa25.22■■□□□ 1.63
HLA-B-250ENST00000434333 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
HLA-B-250ENST00000434333 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
HLA-B-250ENST00000434333 VEZTQ9HBM0 779 aa25.21■■□□□ 1.63
HLA-B-250ENST00000434333 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.21■■□□□ 1.63
HLA-B-250ENST00000434333 EYA2O00167 538 aa25.2■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 DGKZQ13574 1117 aa25.2■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.2■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 KIF16BQ96L93 1317 aa25.19■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 TM4SF4P48230 202 aa25.19■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 BCAMP50895 628 aa25.19■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 CAVIN4Q5BKX8 364 aa25.19■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.19■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 VPS37DQ86XT2 251 aa25.19■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 CRKP46108 304 aa25.18■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 RASA3Q14644 834 aa25.18■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 SPRYD7Q5W111 196 aa25.17■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 LAMB1P07942 1786 aa25.17■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 CCDC85CA6NKD9 419 aa25.16■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 CLMNQ96JQ2 1002 aa25.16■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.15■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa25.15■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
HLA-B-250ENST00000434333 CDAN1Q8IWY9 1227 aa25.14■■□□□ 1.62
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