RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ATG4B-210ENST00000428861 IL15P40933 162 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
ATG4B-210ENST00000428861 C20orf194Q5TEA3 1177 aa13.38□□□□□ -0.27
ATG4B-210ENST00000428861 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
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ATG4B-210ENST00000428861 AKAP2Q9Y2D5 859 aa13.29□□□□□ -0.28
ATG4B-210ENST00000428861 PRDX5P30044 214 aa13.28□□□□□ -0.28
ATG4B-210ENST00000428861 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP13.28□□□□□ -0.28
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ATG4B-210ENST00000428861 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa13.28□□□□□ -0.28
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ATG4B-210ENST00000428861 ZBTB22O15209 634 aa13.27□□□□□ -0.29
ATG4B-210ENST00000428861 AOC2O75106 756 aa13.27□□□□□ -0.29
ATG4B-210ENST00000428861 TNNI3KQ59H18 835 aa13.27□□□□□ -0.29
ATG4B-210ENST00000428861 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
ATG4B-210ENST00000428861 PI16Q6UXB8 463 aa13.27□□□□□ -0.29
ATG4B-210ENST00000428861 CDAN1Q8IWY9 1227 aa13.27□□□□□ -0.29
ATG4B-210ENST00000428861 WDR66Q8TBY9 1149 aa13.27□□□□□ -0.29
ATG4B-210ENST00000428861 CAPNS2Q96L46 248 aa13.27□□□□□ -0.29
ATG4B-210ENST00000428861 DBNDD2Q9BQY9 259 aa13.27□□□□□ -0.29
ATG4B-210ENST00000428861 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
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