RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.33■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CEP290O15078 2479 aa21.32■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OPTNQ96CV9 577 aa21.32■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MS4A4AQ96JQ5 239 aa21.32■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLRN2A0PK11 232 aa21.31■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.31■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPDYE6P0CI01 402 aa21.31■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCNJ4P48050 445 aa21.31■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIF22Q14807 665 aa21.31■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VEZTQ9HBM0 779 aa21.31■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CD209Q9NNX6 404 aa21.31■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GNRH1P01148 92 aa21.3■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GTF2A2P52657 109 aa21.3■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TNFAIP1Q13829 316 aa21.3■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CFAP100Q494V2 611 aa21.3■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.3■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DPF3Q92784 378 aa21.3■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RUNDC1Q96C34 613 aa21.3■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ELP3Q9H9T3 547 aa21.3■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MBIPQ9NS73 344 aa21.3■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYCP01106 439 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KLRK1P26718 216 aa21.29■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRMT2P55345 433 aa21.29■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RASA3Q14644 834 aa21.29■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CERS5Q8N5B7 392 aa21.29■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.29■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SZT2Q5T011 3432 aa21.29■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa21.28■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.28■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCL15Q16663 113 aa21.28■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SH3TC2Q8TF17 1288 aa21.28■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BRI3BPQ8WY22 251 aa21.28■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.28■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.27■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NKX2-3Q8TAU0 364 aa21.27■■□□□ 1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPEF2Q9C093 1822 aa21.27■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 F8W031 263 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HTATIP2Q9BUP3 242 aa21.26■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa21.26■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TLR2O60603 784 aa21.25■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGKV5-2P06315 115 aa21.25■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ITGA6P23229 1130 aa21.25■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.25■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RALBP1Q15311 655 aa21.25■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.25■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KSR2Q6VAB6 950 aa21.25■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYH3P11055 1940 aa21.25■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF853P0CG23 659 aa21.24■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHRNDQ07001 517 aa21.24■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.24■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.24■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NR2E3Q9Y5X4 410 aa21.24■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CSADQ9Y600 493 aa21.24■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PI4KAP2A4QPH2 592 aa21.23■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IL1R1P14778 569 aa21.23■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa21.23■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRO3102Q9H379 93 aa21.23■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IFT57Q9NWB7 429 aa21.23■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1W2PPC1 479 aa21.22■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 H7C1W4 665 aa21.22■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GNAI1P63096 354 aa21.22■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAP3K9P80192 1104 aa21.22■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VGLL4Q14135 290 aa21.22■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa21.22■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SHISA4Q96DD7 197 aa21.22■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.22■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CETPP11597 493 aa21.21■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.21■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.21■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.21■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa21.21■□□□□ 0.99
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OTOFQ9HC10 1997 aa21.2■□□□□ 0.98
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.2■□□□□ 0.98
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TNNI2P48788 182 aa21.2■□□□□ 0.98
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.2■□□□□ 0.98
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AOX1Q06278 1338 aa21.2■□□□□ 0.98
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.2■□□□□ 0.98
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CSF1RP07333 972 aa21.19■□□□□ 0.98
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HOXD10P28358 340 aa21.19■□□□□ 0.98
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GJA8P48165 433 aa21.19■□□□□ 0.98
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TEPSINQ96N21 525 aa21.19■□□□□ 0.98
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SERPINA10Q9UK55 444 aa21.19■□□□□ 0.98
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.18■□□□□ 0.98
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GJB1P08034 283 aa21.18■□□□□ 0.98
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MTFR1Q15390 333 aa21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.7 ms