RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM205AQ6ZU69 1335 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 HDAC9Q9UKV0 1011 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
SH3BP4-204ENST00000416021 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
SH3BP4-204ENST00000416021 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP2B3Q16720 1220 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP4-204ENST00000416021 KLRG1Q96E93 195 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP4-204ENST00000416021 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP26.18■■□□□ 1.788e-6■■■□□ 15.8
SH3BP4-204ENST00000416021 POLA2Q14181 598 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP4-204ENST00000416021 CST9Q5W186 159 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP4-204ENST00000416021 KRT26Q7Z3Y9 468 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP4-204ENST00000416021 COG6Q9Y2V7 657 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP4-204ENST00000416021 F8W031 263 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
SH3BP4-204ENST00000416021 TFCP2Q12800 502 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP4-204ENST00000416021 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
SH3BP4-204ENST00000416021 NBPF9Q3BBW0 867 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP4-204ENST00000416021 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
SH3BP4-204ENST00000416021 DLK2Q6UY11 383 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP4-204ENST00000416021 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
SH3BP4-204ENST00000416021 SSH3Q8TE77 659 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP4-204ENST00000416021 GGA3Q9NZ52 723 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP4-204ENST00000416021 WNT10BO00744 389 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP4-204ENST00000416021 TIMM10P62072 90 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP4-204ENST00000416021 MFSD14BQ5SR56 506 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP4-204ENST00000416021 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
SH3BP4-204ENST00000416021 SULF1Q8IWU6 871 aa26.15■■□□□ 1.78
SH3BP4-204ENST00000416021 AKAP2Q9Y2D5 859 aa26.15■■□□□ 1.78
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1B0GUL6 1792 aa26.15■■□□□ 1.78
SH3BP4-204ENST00000416021 CELF2O95319 508 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
SH3BP4-204ENST00000416021 PDE3AQ14432 1141 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP4-204ENST00000416021 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
SH3BP4-204ENST00000416021 DDX19BQ9UMR2 479 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP4-204ENST00000416021 ADM5C9JUS6 153 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 DLGAP5Q15398 846 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF408Q9H9D4 720 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 SURF6O75683 361 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 CEP85Q6P2H3 762 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 PSME4Q14997 1843 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 ADORA1P30542 326 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 CFAP100Q494V2 611 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 MTMR14Q8NCE2 650 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1B0GUL7 405 aa26.1■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 DEFB115Q30KQ5 88 aa26.1■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 NEUROD6Q96NK8 337 aa26.1■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 PHKA1P46020 1223 aa26.09■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP26.09■■□□□ 1.773e-6■■□□□ 14.2
SH3BP4-204ENST00000416021 GRIK5Q16478 980 aa26.09■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC102BQ68D86 513 aa26.09■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 XAGE2Q96GT9 111 aa26.09■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa26.09■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 JMYQ8N9B5 988 aa26.08■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 TLL2Q9Y6L7 1015 aa26.08■■□□□ 1.77
SH3BP4-204ENST00000416021 RASSF10A6NK89 507 aa26.07■■□□□ 1.76
SH3BP4-204ENST00000416021 WDR66Q8TBY9 1149 aa26.07■■□□□ 1.76
SH3BP4-204ENST00000416021 SERPINA10Q9UK55 444 aa26.07■■□□□ 1.76
SH3BP4-204ENST00000416021 CNTNAP1P78357 1384 aa26.07■■□□□ 1.76
SH3BP4-204ENST00000416021 SPDYE2BA6NHP3 402 aa26.06■■□□□ 1.76
SH3BP4-204ENST00000416021 SPDYE6P0CI01 402 aa26.06■■□□□ 1.76
SH3BP4-204ENST00000416021 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
SH3BP4-204ENST00000416021 CDCA5Q96FF9 252 aa26.06■■□□□ 1.76
SH3BP4-204ENST00000416021 DENND2AQ9ULE3 1009 aa26.06■■□□□ 1.76
SH3BP4-204ENST00000416021 SEMA3EO15041 775 aa26.05■■□□□ 1.76
SH3BP4-204ENST00000416021 VEGFBP49765 207 aa26.05■■□□□ 1.76
SH3BP4-204ENST00000416021 SAPCD2Q86UD0 394 aa26.05■■□□□ 1.76
SH3BP4-204ENST00000416021 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa26.05■■□□□ 1.76
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
SH3BP4-204ENST00000416021 MYO1BO43795 1136 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BP4-204ENST00000416021 GORABQ5T7V8 394 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BP4-204ENST00000416021 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BP4-204ENST00000416021 C2orf69Q8N8R5 385 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BP4-204ENST00000416021 MRIQ9BWK5 157 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BP4-204ENST00000416021 GPR108Q9NPR9 543 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBTB22O15209 634 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP4-204ENST00000416021 CRKP46108 304 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP4-204ENST00000416021 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
SH3BP4-204ENST00000416021 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
SH3BP4-204ENST00000416021 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
SH3BP4-204ENST00000416021 CLRN2A0PK11 232 aa26.01■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 TNNI3KQ59H18 835 aa26.01■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 SIRT2Q8IXJ6 389 aa26.01■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa26.01■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 AOX1Q06278 1338 aa26■■□□□ 1.75
SH3BP4-204ENST00000416021 TEKT1Q969V4 418 aa26■■□□□ 1.75
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