RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407637.5

HERC3-203, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 2,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-203ENST00000407637 GBP6Q6ZN66 633 aa14.7□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 VSTM4Q8IW00 320 aa14.7□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 NEDD4P46934 1319 aa14.7□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 ITSN1Q15811 1721 aa14.7□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 NECTIN2Q92692 538 aa14.7□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.7□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 ARHGEF10O15013 1369 aa14.7□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 MAP4K1Q92918 833 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 USP44Q9H0E7 712 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 PTPRMP28827 1452 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 GOLIM4O00461 696 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 NLRP12P59046 1061 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 MAP9Q49MG5 647 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 GIMAP7Q8NHV1 300 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 SGSM3Q96HU1 749 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 STK31Q9BXU1 1019 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 MAP3K5Q99683 1374 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 PDILTQ8N807 584 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 PCDHA7Q9UN72 937 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 CRB1P82279 1406 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 TRDNQ13061 729 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 RNF217Q8TC41 542 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 ACBD3Q9H3P7 528 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 RABEP2Q9H5N1 569 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 CBFA2T2O43439 604 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 SYF2O95926 243 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 SCRN1Q12765 414 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 MTX1Q13505 466 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 SULT6B1Q6IMI4 303 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 CEP112Q8N8E3 955 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 CDK19Q9BWU1 502 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 POLA2Q14181 598 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 NME9Q86XW9 330 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 CDC23Q9UJX2 597 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 NPATQ14207 1427 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 EBAG9O00559 213 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 C21orf2O43822 256 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 SETQ01105 290 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 GUCY1B3Q02153 619 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 IGSF22Q8N9C0 903 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 PPFIA3O75145 1194 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 GPTP24298 496 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 INPP5BP32019 993 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 GBP3Q9H0R5 595 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 INTS13Q9NVM9 706 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 LMTK2Q8IWU2 1503 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 A0A0U1RQJ8 604 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 IKBKBO14920 756 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 ELF1P32519 619 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 ADKP55263 362 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 MTF1Q14872 753 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 ATRIPQ8WXE1 791 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 EHD4Q9H223 541 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 CDHR2Q9BYE9 1310 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 POTEDQ86YR6 584 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 MIEF2Q96C03 454 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 KAT14Q9H8E8 782 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 CD248Q9HCU0 757 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 CAPN7Q9Y6W3 813 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-203ENST00000407637 A0A0D9SFI3 127 aa14.64□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 MYO1FO00160 1098 aa14.64□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.64□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 SLC24A3Q9HC58 644 aa14.64□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 FANCLQ9NW38 375 aa14.64□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 STX10O60499 249 aa14.64□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 MYL5Q02045 173 aa14.64□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 NEDD9Q14511 834 aa14.64□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 TC2NQ8N9U0 490 aa14.64□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 STAG1Q8WVM7 1258 aa14.64□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 FAXDC2Q96IV6 333 aa14.64□□□□□ -0.07
HERC3-203ENST00000407637 CABS1Q96KC9 395 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms