RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377078.2

USP11-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 5

Gene USP11, Length 1,077 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-202ENST00000377078 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.46■■□□□ 1.03
USP11-202ENST00000377078 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.46■■□□□ 1.03
USP11-202ENST00000377078 SASH1O94885 1247 aa21.45■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 NF2P35240 595 aa21.45■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 DLGAP5Q15398 846 aa21.45■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.45■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 RGMBQ6NW40 437 aa21.45■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 CCDC102AQ96A19 550 aa21.45■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 CA12O43570 354 aa21.44■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 MYO1BO43795 1136 aa21.44■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 AOC2O75106 756 aa21.44■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 PDE8BO95263 885 aa21.44■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 GYG1P46976 350 aa21.44■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 LRRC24Q50LG9 513 aa21.44■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 F8W031 263 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.43■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 CERS5Q8N5B7 392 aa21.42■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.42■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.42■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 JAG2Q9Y219 1238 aa21.42■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 EYA2O00167 538 aa21.41■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 LBX1P52954 281 aa21.41■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.41■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 FBXO3Q9UK99 471 aa21.41■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 GNAI3P08754 354 aa21.4■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 FBXO33Q7Z6M2 555 aa21.4■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.4■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
USP11-202ENST00000377078 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa21.39■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 SLC5A1P13866 664 aa21.39■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 CFAP100Q494V2 611 aa21.39■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.39■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.38■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 SPDYE6P0CI01 402 aa21.38■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.38■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 CIAO1O76071 339 aa21.37■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 LPIN2Q92539 896 aa21.37■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 MEIS3Q99687 375 aa21.37■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 CEP126Q9P2H0 1117 aa21.37■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 SERPINA10Q9UK55 444 aa21.37■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.37■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 SLC10A3P09131 477 aa21.36■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 TRIM27P14373 513 aa21.36■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa21.36■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 ARMC9Q7Z3E5 817 aa21.36■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 SIL1Q9H173 461 aa21.36■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 DEFB129Q9H1M3 183 aa21.35■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 VEZTQ9HBM0 779 aa21.35■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 BCAR3O75815 825 aa21.34■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 FGFR2P21802 821 aa21.34■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 BCAMP50895 628 aa21.34■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 TNFAIP1Q13829 316 aa21.34■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.34■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 CLRN2A0PK11 232 aa21.33■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.33■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 ATG9AQ7Z3C6 839 aa21.33■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
USP11-202ENST00000377078 MAST3O60307 1309 aa21.32■■□□□ 1
USP11-202ENST00000377078 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.32■■□□□ 1
USP11-202ENST00000377078 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.32■■□□□ 1
USP11-202ENST00000377078 SRGAP3O43295 1099 aa21.32■■□□□ 1
USP11-202ENST00000377078 GNAI2P04899 355 aa21.32■■□□□ 1
USP11-202ENST00000377078 ATP2B3Q16720 1220 aa21.32■■□□□ 1
USP11-202ENST00000377078 RASAL3Q86YV0 1011 aa21.32■■□□□ 1
USP11-202ENST00000377078 COPRSQ9NQ92 184 aa21.32■■□□□ 1
USP11-202ENST00000377078 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.32■■□□□ 1
USP11-202ENST00000377078 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.32■■□□□ 1
USP11-202ENST00000377078 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
USP11-202ENST00000377078 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
USP11-202ENST00000377078 MOB2Q70IA6 237 aa21.31■■□□□ 1
USP11-202ENST00000377078 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
USP11-202ENST00000377078 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.31■■□□□ 1
USP11-202ENST00000377078 ZIC5Q96T25 663 aa21.31■■□□□ 1
USP11-202ENST00000377078 SAGE1Q9NXZ1 904 aa21.31■■□□□ 1
USP11-202ENST00000377078 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms