RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373162.5

TRAPPC3-202, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,056 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-202ENST00000373162 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 SASH1O94885 1247 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 FGFR2P21802 821 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 HUNKP57058 714 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 OGFOD1Q8N543 542 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 FBXW7Q969H0 707 aa22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 PDE8BO95263 885 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 GYG1P46976 350 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZIC5Q96T25 663 aa22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 MEIS3Q99687 375 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 AOX1Q06278 1338 aa22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 EYA2O00167 538 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 TNNQ9UQP3 1299 aa22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 FKBP1BP68106 108 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 METTL24Q5JXM2 366 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 RGMBQ6NW40 437 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 BCAR3O75815 825 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 TRIM27P14373 513 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 NOGQ13253 232 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 AIDAQ96BJ3 306 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 FBXO3Q9UK99 471 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 JAG2Q9Y219 1238 aa22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLC10A3P09131 477 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 SPDYE6P0CI01 402 aa22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 CIAO1O76071 339 aa22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 LBX1P52954 281 aa22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 GRM1Q13255 1194 aa22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 MTX1Q13505 466 aa22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 LAMB1P07942 1786 aa22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 GRIK5Q16478 980 aa22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZBTB22O15209 634 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 DLGAP5Q15398 846 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 CFAP100Q494V2 611 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 MOB2Q70IA6 237 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 COPRSQ9NQ92 184 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 CCDC102AQ96A19 550 aa22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 F8W031 263 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 BCAMP50895 628 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 LPIN2Q92539 896 aa22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 CA12O43570 354 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 GNAI3P08754 354 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 MAP3K11Q16584 847 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 CLRN2A0PK11 232 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 SIL1Q9H173 461 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 OTOFQ9HC10 1997 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 CRKP46108 304 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 CSRNP1Q96S65 589 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 MRIQ9BWK5 157 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 TSKSQ9UJT2 592 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLC5A1P13866 664 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 ATP2B3Q16720 1220 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.42■■□□□ 1.18
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