RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 SEMA3EO15041 775 aa36.06■■■■□ 3.36
ECHS1-201ENST00000368547 OSBPL3Q9H4L5 887 aa36.06■■■■□ 3.36
ECHS1-201ENST00000368547 RNF181Q9P0P0 153 aa36.06■■■■□ 3.36
ECHS1-201ENST00000368547 ERC2O15083 957 aa36.05■■■■□ 3.36
ECHS1-201ENST00000368547 PI16Q6UXB8 463 aa36.05■■■■□ 3.36
ECHS1-201ENST00000368547 BOLA2Q9H3K6 86 aa36.05■■■■□ 3.36
ECHS1-201ENST00000368547 KCNQ5Q9NR82 932 aa36.05■■■■□ 3.36
ECHS1-201ENST00000368547 HMG20BQ9P0W2 317 aa36.05■■■■□ 3.36
ECHS1-201ENST00000368547 DENND2AQ9ULE3 1009 aa36.05■■■■□ 3.36
ECHS1-201ENST00000368547 TIAM2Q8IVF5 1701 aa36.05■■■■□ 3.36
ECHS1-201ENST00000368547 C9orf131Q5VYM1 1079 aa36.05■■■■□ 3.36
ECHS1-201ENST00000368547 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP36.05■■■■□ 3.36
ECHS1-201ENST00000368547 SNRKQ9NRH2 765 aa36.05■■■■□ 3.36
ECHS1-201ENST00000368547 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
ECHS1-201ENST00000368547 SPATA5Q8NB90 893 aa36.04■■■■□ 3.36
ECHS1-201ENST00000368547 JAG2Q9Y219 1238 aa36.04■■■■□ 3.36
ECHS1-201ENST00000368547 AOX1Q06278 1338 aa36.04■■■■□ 3.36
ECHS1-201ENST00000368547 PSME4Q14997 1843 aa36.03■■■■□ 3.36
ECHS1-201ENST00000368547 ZBTB22O15209 634 aa36.03■■■■□ 3.36
ECHS1-201ENST00000368547 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
ECHS1-201ENST00000368547 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa36.03■■■■□ 3.36
ECHS1-201ENST00000368547 GTF2IP78347 998 aa36.01■■■■□ 3.36
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP36.01■■■■□ 3.35
ECHS1-201ENST00000368547 FBXW7Q969H0 707 aa36.01■■■■□ 3.35
ECHS1-201ENST00000368547 ZAP70P43403 619 aa36■■■■□ 3.35
ECHS1-201ENST00000368547 TTLL5Q6EMB2 1281 aa36■■■■□ 3.35
ECHS1-201ENST00000368547 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
ECHS1-201ENST00000368547 HAUS7Q99871 368 aa36■■■■□ 3.35
ECHS1-201ENST00000368547 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
ECHS1-201ENST00000368547 FAM205AQ6ZU69 1335 aa35.99■■■■□ 3.35
ECHS1-201ENST00000368547 FZD9O00144 591 aa35.99■■■■□ 3.35
ECHS1-201ENST00000368547 RAD17O75943 681 aa35.99■■■■□ 3.35
ECHS1-201ENST00000368547 USP17L3A6NCW0 530 aa35.98■■■■□ 3.35
ECHS1-201ENST00000368547 USP17L4A6NCW7 530 aa35.98■■■■□ 3.35
ECHS1-201ENST00000368547 USP17L1Q7RTZ2 530 aa35.98■■■■□ 3.35
ECHS1-201ENST00000368547 CXCL9Q07325 125 aa35.97■■■■□ 3.35
ECHS1-201ENST00000368547 STRIP1Q5VSL9 837 aa35.97■■■■□ 3.35
ECHS1-201ENST00000368547 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa35.96■■■■□ 3.35
ECHS1-201ENST00000368547 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
ECHS1-201ENST00000368547 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
ECHS1-201ENST00000368547 EIF6P56537 245 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
ECHS1-201ENST00000368547 TTC22Q5TAA0 569 aa35.95■■■■□ 3.35
ECHS1-201ENST00000368547 WDR66Q8TBY9 1149 aa35.95■■■■□ 3.35
ECHS1-201ENST00000368547 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
ECHS1-201ENST00000368547 PAG1Q9NWQ8 432 aa35.94■■■■□ 3.34
ECHS1-201ENST00000368547 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
ECHS1-201ENST00000368547 GOLIM4O00461 696 aa35.94■■■■□ 3.34
ECHS1-201ENST00000368547 PSMD14O00487 310 aa35.94■■■■□ 3.34
ECHS1-201ENST00000368547 DACT2Q5SW24 774 aa35.94■■■■□ 3.34
ECHS1-201ENST00000368547 CIAPIN1Q6FI81 312 aa35.94■■■■□ 3.34
ECHS1-201ENST00000368547 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa35.94■■■■□ 3.34
ECHS1-201ENST00000368547 ANTXR1Q9H6X2 564 aa35.94■■■■□ 3.34
ECHS1-201ENST00000368547 MFSD14BQ5SR56 506 aa35.93■■■■□ 3.34
ECHS1-201ENST00000368547 MXD3Q9BW11 206 aa35.93■■■■□ 3.34
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF541Q9H0D2 1346 aa35.92■■■■□ 3.34
ECHS1-201ENST00000368547 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa35.92■■■■□ 3.34
ECHS1-201ENST00000368547 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
ECHS1-201ENST00000368547 ABCF2Q9UG63 623 aa35.91■■■■□ 3.34
ECHS1-201ENST00000368547 SALL1Q9NSC2 1324 aa35.91■■■■□ 3.34
ECHS1-201ENST00000368547 TNIP1Q15025 636 aa35.9■■■■□ 3.34
ECHS1-201ENST00000368547 VIL1P09327 827 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
ECHS1-201ENST00000368547 CERS5Q8N5B7 392 aa35.9■■■■□ 3.34
ECHS1-201ENST00000368547 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
ECHS1-201ENST00000368547 DOCK2Q92608 1830 aa35.89■■■■□ 3.34
ECHS1-201ENST00000368547 AK9Q5TCS8 1911 aa35.89■■■■□ 3.34
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa35.89■■■■□ 3.34
ECHS1-201ENST00000368547 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
ECHS1-201ENST00000368547 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
ECHS1-201ENST00000368547 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
ECHS1-201ENST00000368547 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
ECHS1-201ENST00000368547 GJA3Q9Y6H8 435 aa35.87■■■■□ 3.33
ECHS1-201ENST00000368547 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
ECHS1-201ENST00000368547 LRP2BPQ9P2M1 347 aa35.86■■■■□ 3.33
ECHS1-201ENST00000368547 PRDX5P30044 214 aa35.86■■■■□ 3.33
ECHS1-201ENST00000368547 GRIK5Q16478 980 aa35.86■■■■□ 3.33
ECHS1-201ENST00000368547 RILPL2Q969X0 211 aa35.86■■■■□ 3.33
ECHS1-201ENST00000368547 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
ECHS1-201ENST00000368547 EVI5LQ96CN4 794 aa35.85■■■■□ 3.33
ECHS1-201ENST00000368547 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
ECHS1-201ENST00000368547 CNTROBQ8N137 903 aa35.84■■■■□ 3.33
ECHS1-201ENST00000368547 BACH2Q9BYV9 841 aa35.84■■■■□ 3.33
ECHS1-201ENST00000368547 MYO3BQ8WXR4 1341 aa35.84■■■■□ 3.33
ECHS1-201ENST00000368547 IDH1O75874 414 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
ECHS1-201ENST00000368547 LDHBP07195 334 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
ECHS1-201ENST00000368547 ERICH6Q7L0X2 663 aa35.83■■■■□ 3.33
ECHS1-201ENST00000368547 GPC2Q8N158 579 aa35.83■■■■□ 3.33
ECHS1-201ENST00000368547 MYH7P12883 1935 aa35.83■■■■□ 3.33
ECHS1-201ENST00000368547 SDSP20132 328 aa35.83■■■■□ 3.33
ECHS1-201ENST00000368547 BMP2KLQ5H9B9 411 aa35.83■■■■□ 3.33
ECHS1-201ENST00000368547 KBTBD3Q8NAB2 608 aa35.83■■■■□ 3.33
ECHS1-201ENST00000368547 RAI14Q9P0K7 980 aa35.82■■■■□ 3.32
ECHS1-201ENST00000368547 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa35.82■■■■□ 3.32
ECHS1-201ENST00000368547 F8W031 263 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA0825Q8IV33 1275 aa35.81■■■■□ 3.32
ECHS1-201ENST00000368547 AGBL3Q8NEM8 1001 aa35.81■■■■□ 3.32
ECHS1-201ENST00000368547 GMLQ99445 158 aa35.81■■■■□ 3.32
ECHS1-201ENST00000368547 FSD1Q9BTV5 496 aa35.81■■■■□ 3.32
ECHS1-201ENST00000368547 MAST2Q6P0Q8 1798 aa35.8■■■■□ 3.32
ECHS1-201ENST00000368547 DDNO94850 711 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
ECHS1-201ENST00000368547 MAP3K12Q12852 859 aa35.79■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.6 ms