RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 CTNNA2P26232 953 aa24.03■■□□□ 1.44
SMURF1-201ENST00000361125 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SMURF1-201ENST00000361125 MBD4O95243 580 aa24.03■■□□□ 1.44
SMURF1-201ENST00000361125 ASIC1P78348 528 aa24.03■■□□□ 1.44
SMURF1-201ENST00000361125 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.03■■□□□ 1.44
SMURF1-201ENST00000361125 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SMURF1-201ENST00000361125 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SMURF1-201ENST00000361125 MCM3P25205 808 aa24.02■■□□□ 1.44
SMURF1-201ENST00000361125 C6orf50Q9HD87 102 aa24.02■■□□□ 1.44
SMURF1-201ENST00000361125 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SMURF1-201ENST00000361125 MCM7P33993 719 aa24.02■■□□□ 1.44
SMURF1-201ENST00000361125 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SMURF1-201ENST00000361125 EZRP15311 586 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SMURF1-201ENST00000361125 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.02■■□□□ 1.44
SMURF1-201ENST00000361125 GNG11P61952 73 aa24.01■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 TRIM75PA6NK02 468 aa24.01■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP24.01■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.01■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 A0A1B0GUL7 405 aa24■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC174Q6PII3 467 aa24■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 USP19O94966 1318 aa24■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 SAMD9Q5K651 1589 aa24■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 TNNI2P48788 182 aa24■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 PLS1Q14651 629 aa24■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 TNNI3KQ59H18 835 aa24■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa24■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 ATP10AO60312 1499 aa24■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 HELLSQ9NRZ9 838 aa23.99■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP23.99■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 PLIN2Q99541 437 aa23.99■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 RBSNQ9H1K0 784 aa23.99■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 SKILP12757 684 aa23.98■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 TYRO3Q06418 890 aa23.98■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 CTAGE1Q96RT6 745 aa23.98■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 AKR1B10O60218 316 aa23.98■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa23.97■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 ZMYND15Q9H091 742 aa23.97■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.97■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 A1BGP04217 495 aa23.97■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 RAD50Q92878 1312 aa23.97■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.97■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 PLCG2P16885 1265 aa23.97■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 ARMT1Q9H993 441 aa23.97■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP23.97■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 EYA2O00167 538 aa23.97■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.96■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 SPDYE3A6NKU9 549 aa23.96■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 XAGE2Q96GT9 111 aa23.96■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 SHTN1A0MZ66 631 aa23.96■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 TBC1D5Q92609 795 aa23.96■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.96■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 CLEC11AQ9Y240 323 aa23.96■■□□□ 1.43
SMURF1-201ENST00000361125 PTGS1P23219 599 aa23.95■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 SUCLG2Q96I99 432 aa23.95■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 B4E1Z4 1266 aa23.95■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 CALML3P27482 149 aa23.95■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 STX17P56962 302 aa23.95■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 DRC1Q96MC2 740 aa23.95■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 SPAG5Q96R06 1193 aa23.95■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 CNBD1Q8NA66 436 aa23.95■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 PSMA7O14818 248 aa23.94■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC91Q7Z6B0 441 aa23.94■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 HOOK3Q86VS8 718 aa23.94■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 GRM1Q13255 1194 aa23.94■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 UFL1O94874 794 aa23.94■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.94■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 CHL1O00533 1208 aa23.94■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 SLC27A2O14975 620 aa23.94■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa23.94■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 TAF5LO75529 589 aa23.93■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 TRAF1Q13077 416 aa23.93■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.93■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 RPS6KB1P23443 525 aa23.93■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 KRT13P13646 458 aa23.93■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa23.93■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 EYA3Q99504 573 aa23.93■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 SPECC1Q5M775 1068 aa23.92■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 KRT79Q5XKE5 535 aa23.92■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 FAM227BQ96M60 508 aa23.92■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 POTEB2H3BUK9 544 aa23.92■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 MYZAPP0CAP1 466 aa23.92■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.92■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 PDE8AO60658 829 aa23.92■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 SYT1P21579 422 aa23.92■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.92■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.92■■□□□ 1.42
SMURF1-201ENST00000361125 ARID5AQ03989 594 aa23.92■■□□□ 1.42
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