RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360954.2

HS3ST3B1-201, Transcript of heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3B1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HS3ST3B1, Length 5,367 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MAGEB6Q8N7X4 407 aa18.5■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP18.5■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SPAG5Q96R06 1193 aa18.5■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TMEM2Q9UHN6 1383 aa18.5■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP18.5■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa18.49■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 INCENPQ9NQS7 918 aa18.49■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TMCO5BA8MYB1 307 aa18.49■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TUBBP07437 444 aa18.49■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KRT13P13646 458 aa18.49■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC52A2Q9HAB3 445 aa18.49■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SH3TC1Q8TE82 1336 aa18.49■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LDHBP07195 334 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RILPL1Q5EBL4 403 aa18.49■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TTC6Q86TZ1 520 aa18.49■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 AOPEPQ8N6M6 819 aa18.49■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 IQUBQ8NA54 791 aa18.49■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa18.48■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 APOBRQ0VD83 1088 aa18.48■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 APPBP2Q92624 585 aa18.48■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SAMM50Q9Y512 469 aa18.48■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ELP1O95163 1332 aa18.48■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KDM5DQ9BY66 1539 aa18.48■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MYO5CQ9NQX4 1742 aa18.48■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 AFMP43652 599 aa18.48■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ASIC1P78348 528 aa18.48■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CCDC186Q7Z3E2 898 aa18.48■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FERMT1Q9BQL6 677 aa18.48■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PDE8AO60658 829 aa18.48■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CCDC175P0C221 793 aa18.48■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NOP2P46087 812 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DNAJC25Q9H1X3 360 aa18.48■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SSH2Q76I76 1423 aa18.48■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FERMT2Q96AC1 680 aa18.48■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa18.48■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SYT1P21579 422 aa18.47■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CEP112Q8N8E3 955 aa18.47■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LMBR1Q8WVP7 490 aa18.47■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GLT8D2Q9H1C3 349 aa18.47■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MCM9Q9NXL9 1143 aa18.47■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SGSM2O43147 1006 aa18.47■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa18.47■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ACSBG1Q96GR2 724 aa18.47■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 JADE2Q9NQC1 790 aa18.47■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CTAGE15A4D2H0 777 aa18.46■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TACC1O75410 805 aa18.46■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CTAGE8P0CG41 777 aa18.46■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 G2E3Q7L622 706 aa18.46■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CTAGE6Q86UF2 777 aa18.46■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CTAGE4Q8IX94 777 aa18.46■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 A0A1B0GUL7 405 aa18.46■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FAM160A1Q05DH4 1040 aa18.46■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP18.46■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SELENOOQ9BVL4 669 aa18.46■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CTNNA2P26232 953 aa18.46■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa18.46■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SPDYE3A6NKU9 549 aa18.45■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DEXIO95424 95 aa18.45■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MYOM2P54296 1465 aa18.45■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DTHD1Q6ZMT9 781 aa18.45■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TM6SF1Q9BZW5 370 aa18.45■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SPECC1Q5M775 1068 aa18.45■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ISM2Q6H9L7 571 aa18.45■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CABLES1Q8TDN4 633 aa18.45■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FAM135BQ49AJ0 1406 aa18.45■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC27A2O14975 620 aa18.45■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KRT86O43790 486 aa18.45■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KBTBD3Q8NAB2 608 aa18.45■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DHX58Q96C10 678 aa18.45■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 AATKQ6ZMQ8 1374 aa18.45■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ABCC4O15439 1325 aa18.45■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CTR9Q6PD62 1173 aa18.45■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ERBB4Q15303 1308 aa18.44■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SH2D4AQ9H788 454 aa18.44■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 STK24Q9Y6E0 443 aa18.44■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CLASP1Q7Z460 1538 aa18.44■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MAST3O60307 1309 aa18.44■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 UBAP1LF5GYI3 381 aa18.44■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 USP19O94966 1318 aa18.44■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PLCD1P51178 756 aa18.44■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GOPCQ9HD26 462 aa18.44■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa18.43■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 WDR78Q5VTH9 848 aa18.43■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SYNMO15061 1565 aa18.43■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MBD4O95243 580 aa18.43■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ITGA6P23229 1130 aa18.43■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KIAA0753Q2KHM9 967 aa18.43■□□□□ 0.54
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms