RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 ADD2P35612 726 aa22.61■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 SLIT2O94813 1529 aa22.61■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 PHKA1P46020 1223 aa22.6■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.6■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22.6■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 ZNF213O14771 459 aa22.6■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 NR1I2O75469 434 aa22.6■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 CCDC102BQ68D86 513 aa22.6■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.6■■□□□ 1.21
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USP21-201ENST00000289865 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 EVCP57679 992 aa22.59■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 PLCB2Q00722 1185 aa22.59■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 GUCY1B3Q02153 619 aa22.59■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 TYRO3Q06418 890 aa22.59■■□□□ 1.21
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USP21-201ENST00000289865 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 NCOA7Q8NI08 942 aa22.59■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.59■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.59■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 LRP5O75197 1615 aa22.59■■□□□ 1.21
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USP21-201ENST00000289865 FAM177BA6PVY3 158 aa22.58■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 SUSD4Q5VX71 490 aa22.58■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.58■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.58■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa22.57■■□□□ 1.2
USP21-201ENST00000289865 ADAMTS2O95450 1211 aa22.57■■□□□ 1.2
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USP21-201ENST00000289865 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.57■■□□□ 1.2
USP21-201ENST00000289865 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.57■■□□□ 1.2
USP21-201ENST00000289865 ATRNO75882 1429 aa22.57■■□□□ 1.2
USP21-201ENST00000289865 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
USP21-201ENST00000289865 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.57■■□□□ 1.2
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USP21-201ENST00000289865 DDB1Q16531 1140 aa22.57■■□□□ 1.2
USP21-201ENST00000289865 LPIN2Q92539 896 aa22.57■■□□□ 1.2
USP21-201ENST00000289865 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.56■■□□□ 1.2
USP21-201ENST00000289865 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.56■■□□□ 1.2
USP21-201ENST00000289865 ATP6V1AP38606 617 aa22.56■■□□□ 1.2
USP21-201ENST00000289865 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.56■■□□□ 1.2
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USP21-201ENST00000289865 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.56■■□□□ 1.2
USP21-201ENST00000289865 PDE6AP16499 860 aa22.55■■□□□ 1.2
USP21-201ENST00000289865 NBPF3Q9H094 633 aa22.55■■□□□ 1.2
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USP21-201ENST00000289865 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.55■■□□□ 1.2
USP21-201ENST00000289865 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
USP21-201ENST00000289865 USP28Q96RU2 1077 aa22.55■■□□□ 1.2
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USP21-201ENST00000289865 SLC5A1P13866 664 aa22.54■■□□□ 1.2
USP21-201ENST00000289865 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
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USP21-201ENST00000289865 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.53■■□□□ 1.2
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USP21-201ENST00000289865 SNAP23O00161 211 aa22.53■■□□□ 1.2
USP21-201ENST00000289865 TRDNQ13061 729 aa22.53■■□□□ 1.2
USP21-201ENST00000289865 ATL3Q6DD88 541 aa22.53■■□□□ 1.2
USP21-201ENST00000289865 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.53■■□□□ 1.2
USP21-201ENST00000289865 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.53■■□□□ 1.2
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USP21-201ENST00000289865 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.52■■□□□ 1.2
USP21-201ENST00000289865 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.52■■□□□ 1.2
USP21-201ENST00000289865 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
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USP21-201ENST00000289865 CAMTA2O94983 1202 aa22.52■■□□□ 1.2
USP21-201ENST00000289865 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.52■■□□□ 1.2
USP21-201ENST00000289865 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.52■■□□□ 1.2
USP21-201ENST00000289865 LUZP1Q86V48 1076 aa22.52■■□□□ 1.2
USP21-201ENST00000289865 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
USP21-201ENST00000289865 SPATA5Q8NB90 893 aa22.52■■□□□ 1.2
USP21-201ENST00000289865 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
USP21-201ENST00000289865 ITPK1Q13572 414 aa22.51■■□□□ 1.19
USP21-201ENST00000289865 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.51■■□□□ 1.19
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