RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246139.9

CITED1-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-201ENST00000246139 MMP14P50281 582 aa26.19■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 UBE4AQ14139 1066 aa26.19■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 RGMBQ6NW40 437 aa26.19■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 KLHDC4Q8TBB5 520 aa26.19■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 CDCA5Q96FF9 252 aa26.19■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 IL1R1P14778 569 aa26.18■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 LRRC24Q50LG9 513 aa26.18■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 MCOLN1Q9GZU1 580 aa26.18■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 JAG2Q9Y219 1238 aa26.18■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 A0A1B0GUL6 1792 aa26.18■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 WNT10BO00744 389 aa26.17■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 SASH1O94885 1247 aa26.17■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 METTL24Q5JXM2 366 aa26.17■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.16■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa26.16■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 HDAC5Q9UQL6 1122 aa26.16■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 F8W031 263 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 GYG1P46976 350 aa26.15■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 TRIM27P14373 513 aa26.14■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.14■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 VPS37DQ86XT2 251 aa26.14■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 CERS5Q8N5B7 392 aa26.14■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 MEIS3Q99687 375 aa26.14■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
CITED1-201ENST00000246139 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 DLGAP5Q15398 846 aa26.13■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa26.13■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 PDE8BO95263 885 aa26.12■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 TNNQ9UQP3 1299 aa26.12■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 EYA2O00167 538 aa26.11■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 GNAI3P08754 354 aa26.11■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 DGKZQ13574 1117 aa26.11■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 VGLL2Q8N8G2 317 aa26.11■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 CCDC102AQ96A19 550 aa26.11■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.11■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 RGS19P49795 217 aa26.1■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 CAVIN4Q5BKX8 364 aa26.1■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.1■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 AKAP11Q9UKA4 1901 aa26.1■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 SLC10A3P09131 477 aa26.09■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP26.09■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 RNF186Q9NXI6 227 aa26.09■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 NF2P35240 595 aa26.08■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 CFAP100Q494V2 611 aa26.08■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 MFSD14BQ5SR56 506 aa26.08■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 MOB2Q70IA6 237 aa26.08■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 CSRNP1Q96S65 589 aa26.08■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 FAM205AQ6ZU69 1335 aa26.08■■□□□ 1.77
CITED1-201ENST00000246139 TRPA1O75762 1119 aa26.07■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 FKBP1BP68106 108 aa26.07■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 FBXO33Q7Z6M2 555 aa26.07■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 SIL1Q9H173 461 aa26.07■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 MYO1BO43795 1136 aa26.06■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 ATG9AQ7Z3C6 839 aa26.06■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 FBXO3Q9UK99 471 aa26.06■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 RASAL3Q86YV0 1011 aa26.05■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 MTMR14Q8NCE2 650 aa26.05■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 SAGE1Q9NXZ1 904 aa26.05■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa26.05■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 UBE2Q2LH0YL09 131 aa26.04■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 CIAO1O76071 339 aa26.04■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 FGFR2P21802 821 aa26.04■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 BCAMP50895 628 aa26.04■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.04■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa26.04■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 CLRN2A0PK11 232 aa26.03■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 SPDYE2BA6NHP3 402 aa26.03■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 SPDYE6P0CI01 402 aa26.03■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 VEZTQ9HBM0 779 aa26.03■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 SLC5A1P13866 664 aa26.02■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 PRKG1Q13976 671 aa26.02■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 LPIN2Q92539 896 aa26.02■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 DEFB129Q9H1M3 183 aa26.02■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 COPRSQ9NQ92 184 aa26.02■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 CEP126Q9P2H0 1117 aa26.02■■□□□ 1.76
CITED1-201ENST00000246139 SRGAP3O43295 1099 aa26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms