RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236192.11

VAMP4-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP4, Length 5,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4-201ENST00000236192 CCDC96Q2M329 555 aa14.53□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 CCDC63Q8NA47 563 aa14.53□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 CFAP43Q8NDM7 1665 aa14.53□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 SPAG1Q07617 926 aa14.53□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 SPTLC2O15270 562 aa14.53□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 TEFQ10587 303 aa14.53□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 CCDC122Q5T0U0 273 aa14.53□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 TRIM58Q8NG06 486 aa14.53□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 ZDHHC9Q9Y397 364 aa14.53□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa14.53□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 TADA3O75528 432 aa14.53□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 FAM173BQ6P4H8 233 aa14.53□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 SLC30A9Q6PML9 568 aa14.53□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 CYP26C1Q6V0L0 522 aa14.53□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 STX10O60499 249 aa14.52□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 DNA2P51530 1060 aa14.52□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 NLRP5P59047 1200 aa14.52□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 SETDB1Q15047 1291 aa14.52□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 STIM2Q9P246 746 aa14.52□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 SSH2Q76I76 1423 aa14.52□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 IDEP14735 1019 aa14.52□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 CEP85Q6P2H3 762 aa14.52□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 CDC37L1Q7L3B6 337 aa14.52□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 DHX58Q96C10 678 aa14.52□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 NEK1Q96PY6 1258 aa14.52□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 LCMT1Q9UIC8 334 aa14.52□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 SNX14Q9Y5W7 946 aa14.52□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
VAMP4-201ENST00000236192 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 C8orf74Q6P047 294 aa14.52□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 TTC6Q86TZ1 520 aa14.52□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 CCDC144BQ3MJ40 725 aa14.52□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14.52□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 TSGA10Q9BZW7 698 aa14.52□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.52□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 CEP104O60308 925 aa14.51□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 ARID5BQ14865 1188 aa14.51□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 CCDC57Q2TAC2 916 aa14.51□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 CFAP70Q5T0N1 1121 aa14.51□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 TMTC1Q8IUR5 882 aa14.51□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 IGSF22Q8N9C0 903 aa14.51□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 WASF1Q92558 559 aa14.51□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 POLE2P56282 527 aa14.51□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.51□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 VIMP08670 466 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 OSBPL9Q96SU4 736 aa14.51□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 ENO4A6NNW6 628 aa14.51□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 AMOTL1Q8IY63 956 aa14.51□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 A0A1B0GVL5 298 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 PAK2Q13177 524 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 WASHC4Q2M389 1173 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 MUM1Q2TAK8 710 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 ARMC9Q7Z3E5 817 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 WHAMMQ8TF30 809 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 ABCC2Q92887 1545 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 PRPHP41219 470 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 SCRN1Q12765 414 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 RASEFQ8IZ41 740 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 IQUBQ8NA54 791 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 EID1Q9Y6B2 187 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 SAR1BQ9Y6B6 198 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 CCDC170Q8IYT3 715 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 KIF2CQ99661 725 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 CABP2Q9NPB3 220 aa14.5□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 TRIM14Q14142 442 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 TAF11Q15544 211 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 GRIPAP1Q4V328 841 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 RNF217Q8TC41 542 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 DDX58O95786 925 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 DRP2Q13474 957 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 RASIP1Q5U651 963 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 TAOK3Q9H2K8 898 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 MARCH6O60337 910 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 NYAP1Q6ZVC0 841 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 PSEN1P49768 467 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 LRRC45Q96CN5 670 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 TESK2Q96S53 571 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 KIF9Q9HAQ2 790 aa14.49□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
VAMP4-201ENST00000236192 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms