RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222753.5

HOXA13-201, Transcript of homeobox A13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA13, Length 5,030 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-201ENST00000222753 KRBA2Q6ZNG9 492 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXA13-201ENST00000222753 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
HOXA13-201ENST00000222753 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXA13-201ENST00000222753 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXA13-201ENST00000222753 ARHGAP6O43182 974 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC172P0C7W6 258 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXA13-201ENST00000222753 GUCA1BQ9UMX6 200 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXA13-201ENST00000222753 FANCCQ00597 558 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXA13-201ENST00000222753 KIAA0753Q2KHM9 967 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXA13-201ENST00000222753 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
HOXA13-201ENST00000222753 A6NNZ2 444 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 PHACTR2O75167 634 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 TUBB8Q3ZCM7 444 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 CARD6Q9BX69 1037 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 TCERG1LQ5VWI1 586 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 G2E3Q7L622 706 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 SPAG5Q96R06 1193 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 GNAQP50148 359 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 TRIM14Q14142 442 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 IL13P35225 146 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC121Q6ZUS5 278 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF521Q96K83 1311 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 BICDL2A1A5D9 508 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 TNIP1Q15025 636 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 HOXB7P09629 217 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 CHMP4BP1P59074 171 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 ANO1Q5XXA6 986 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 DDX12PQ92771 950 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 PTPRTO14522 1441 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 CALM1P0DP23 149 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 CALM2P0DP24 149 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 CALM3P0DP25 149 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 FAM173BQ6P4H8 233 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 IQUBQ8NA54 791 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 UBXN1Q04323 297 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 GPT2Q8TD30 523 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 ADAMTS12P58397 1594 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 CALML3P27482 149 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP21.05■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 ANKS4BQ8N8V4 417 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 DRC1Q96MC2 740 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 PLVAPQ9BX97 442 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 LDHCP07864 332 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 NLRP12P59046 1061 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 RILPL1Q5EBL4 403 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 HOOK3Q86VS8 718 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 PRPHP41219 470 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 AFAP1L1Q8TED9 768 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 EXOC5O00471 708 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 STX17P56962 302 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 MLKLQ8NB16 471 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 LMBR1Q8WVP7 490 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 TSGA10Q9BZW7 698 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 RTL9Q8NET4 1388 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 KIAA0232Q92628 1395 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 GNAT2P19087 354 aa21.03■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 GPTP24298 496 aa21.03■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.03■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 SLF2Q8IX21 1173 aa21.03■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 ADAMTS2O95450 1211 aa21.03■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 IGSF22Q8N9C0 903 aa21.03■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa21.03■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.02■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 ZPR1O75312 459 aa21.02■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 CHST3Q7LGC8 479 aa21.02■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 CAPZA3Q96KX2 299 aa21.02■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 RASAL2Q9UJF2 1139 aa21.02■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 ASIC1P78348 528 aa21.02■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 CDC37L1Q7L3B6 337 aa21.02■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 TFCP2Q12800 502 aa21.02■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC122Q5T0U0 273 aa21.02■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 CFAP58Q5T655 872 aa21.02■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 MSL1Q68DK7 614 aa21.02■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 EYA1Q99502 592 aa21.02■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.02■□□□□ 0.96
HOXA13-201ENST00000222753 KRT2P35908 639 aa21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 134.1 ms