RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000088716.11

Smarcc1-201, Transcript of SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Smarcc1, Length 5,717 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Kdm1aQ6ZQ88 853 aa24.38■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 PxdnQ3UQ28 1475 aa24.38■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 CrklP47941 303 aa24.38■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Rps6kb1Q8BSK8 525 aa24.38■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Ncaph2Q8BSP2 607 aa24.38■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Zmynd15Q8C0R7 736 aa24.38■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Zswim4Q8C7B8 1101 aa24.38■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Paip2Q9D6V8 124 aa24.38■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Apol10bG3X9K7 334 aa24.37■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Lmbrd2Q8C561 694 aa24.37■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Ubxn1Q922Y1 297 aa24.37■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Mlh1Q9JK91 760 aa24.37■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Zkscan16A2ALW2 728 aa24.37■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Asic3Q6X1Y6 530 aa24.37■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Ccdc113Q8C5T8 377 aa24.37■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Rbm17Q8JZX4 405 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Eid1Q9DCR4 169 aa24.37■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Nsd3Q6P2L6 1439 aa24.37■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Ppfibp2O35711 882 aa24.37■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Prl3d3A0A0M6L0J6 224 aa24.37■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Gm1993A6X8I0 212 aa24.37■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 1700018F24RikB2RW27 314 aa24.37■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 SlxD3Z347 212 aa24.37■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Kif17Q99PW8 1038 aa24.37■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Kif21aQ9QXL2 1672 aa24.37■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Gadd45bP22339 160 aa24.36■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Rab3il1Q8VDV3 383 aa24.36■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Samd9lQ69Z37 1561 aa24.36■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Skint5A7XUY5 1461 aa24.36■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Prl3d2F6R3P9 224 aa24.36■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Tut1Q8R3F9 869 aa24.36■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Mxra7Q9CZH7 178 aa24.36■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Eya2O08575 532 aa24.36■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Sult6b1P0CC03 303 aa24.36■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Ca8P28651 291 aa24.36■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Ccdc129Q14B48 1034 aa24.36■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Hexim1Q8R409 356 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Tubb4bP68372 445 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Ubash3aQ3V3E1 624 aa24.35■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Pex1Q5BL07 1284 aa24.35■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Stk36Q69ZM6 1316 aa24.35■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Prr16A3KMN5 304 aa24.35■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Sept7O55131 436 aa24.35■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Nek5Q7TSC3 627 aa24.35■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Kiaa1024Q8K3V7 917 aa24.35■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Sdccag8Q80UF4 717 aa24.35■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Parp1P11103 1013 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Snapc4Q8BP86 1333 aa24.34■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Mcm7Q61881 719 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Tpd52l2Q9CYZ2 220 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Eif3j1Q3UGC7 261 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Gas2l2Q5SSG4 860 aa24.34■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Eif3j2Q66JS6 263 aa24.34■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Slc39a6Q8C145 765 aa24.34■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Map3k19E9Q3S4 1311 aa24.34■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Rpl13P47963 211 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Fam204aQ8C6C7 236 aa24.34■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Pcdhb22Q91XZ8 794 aa24.33■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Krt13P08730 437 aa24.33■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Csrnp2Q8BGQ2 534 aa24.33■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Taok3Q8BYC6 898 aa24.33■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Shroom2A2ALU4 1481 aa24.33■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 DonsonQ9QXP4 560 aa24.33■■□□□ 1.49
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Ccdc162pQ0VG85 912 aa24.33■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Kank4Q6P9J5 1016 aa24.33■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Bst2Q8R2Q8 172 aa24.33■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Ccdc121E9Q6D3 323 aa24.32■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Ubac1Q8VDI7 409 aa24.32■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 NmiO35309 314 aa24.32■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Capn12Q9ER56 720 aa24.32■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Zbtb45Q52KG4 520 aa24.32■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 NapaQ9DB05 295 aa24.32■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Ublcp1Q8BGR9 318 aa24.32■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Foxo3Q9WVH4 672 aa24.32■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Sp4Q62445 782 aa24.32■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Calml3Q9D6P8 149 aa24.32■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 LratQ9JI60 231 aa24.32■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 LdhaP06151 332 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Timm10P62073 90 aa24.31■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Ccdc25Q78PG9 208 aa24.31■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Stoml1Q8CI66 399 aa24.31■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Dcaf17Q3TUL7 519 aa24.31■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Utp18Q5SSI6 552 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Usp11Q99K46 921 aa24.31■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Fmnl3Q6ZPF4 1028 aa24.31■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Gm29094F6Q785 221 aa24.31■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Opa1P58281 960 aa24.31■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Disp1Q3TDN0 1521 aa24.31■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Gm12185Q5NCB2 835 aa24.31■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Plcd1Q8R3B1 756 aa24.31■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Abcc2Q8VI47 1543 aa24.31■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Ccpg1Q640L3 753 aa24.3■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Lin9Q8C735 542 aa24.3■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Abcb4P21440 1276 aa24.3■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Rapgef1Q3UHC1 1224 aa24.3■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Gm28047Q3US59 414 aa24.3■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Nfil3O08750 462 aa24.3■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa24.3■■□□□ 1.48
Smarcc1-201ENSMUST00000088716 Jade3Q6IE82 823 aa24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 77.6 ms