Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K7

Apol10b, Apolipoprotein L 10B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol10bG3X9K7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
Apol10bG3X9K7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Apol10bG3X9K7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Apol10bG3X9K7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Apol10bG3X9K7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Apol10bG3X9K7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Apol10bG3X9K7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Apol10bG3X9K7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Apol10bG3X9K7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Apol10bG3X9K7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Apol10bG3X9K7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Apol10bG3X9K7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Apol10bG3X9K7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Apol10bG3X9K7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Apol10bG3X9K7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Apol10bG3X9K7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Apol10bG3X9K7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Apol10bG3X9K7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Apol10bG3X9K7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Apol10bG3X9K7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Apol10bG3X9K7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Apol10bG3X9K7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Apol10bG3X9K7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Apol10bG3X9K7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Apol10bG3X9K7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Apol10bG3X9K7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Apol10bG3X9K7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Apol10bG3X9K7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Apol10bG3X9K7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Apol10bG3X9K7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Apol10bG3X9K7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Apol10bG3X9K7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Apol10bG3X9K7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Apol10bG3X9K7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Apol10bG3X9K7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Apol10bG3X9K7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Apol10bG3X9K7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Apol10bG3X9K7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Apol10bG3X9K7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Apol10bG3X9K7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Apol10bG3X9K7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Apol10bG3X9K7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Apol10bG3X9K7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Apol10bG3X9K7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Apol10bG3X9K7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Apol10bG3X9K7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Apol10bG3X9K7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Apol10bG3X9K7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Apol10bG3X9K7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Apol10bG3X9K7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Apol10bG3X9K7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Apol10bG3X9K7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Apol10bG3X9K7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Apol10bG3X9K7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Apol10bG3X9K7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Apol10bG3X9K7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Apol10bG3X9K7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Apol10bG3X9K7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Apol10bG3X9K7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Apol10bG3X9K7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Apol10bG3X9K7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Apol10bG3X9K7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Apol10bG3X9K7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Apol10bG3X9K7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Apol10bG3X9K7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Apol10bG3X9K7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Apol10bG3X9K7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Apol10bG3X9K7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Apol10bG3X9K7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Apol10bG3X9K7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Apol10bG3X9K7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Apol10bG3X9K7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Apol10bG3X9K7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Apol10bG3X9K7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Apol10bG3X9K7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Apol10bG3X9K7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Apol10bG3X9K7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Apol10bG3X9K7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Apol10bG3X9K7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Apol10bG3X9K7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Apol10bG3X9K7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Apol10bG3X9K7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Apol10bG3X9K7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Apol10bG3X9K7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Apol10bG3X9K7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Apol10bG3X9K7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Apol10bG3X9K7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Apol10bG3X9K7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Apol10bG3X9K7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Apol10bG3X9K7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Apol10bG3X9K7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Apol10bG3X9K7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Apol10bG3X9K7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Apol10bG3X9K7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Apol10bG3X9K7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Apol10bG3X9K7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Apol10bG3X9K7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Apol10bG3X9K7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Apol10bG3X9K7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Apol10bG3X9K7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms