Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE82

Jade3, Protein Jade-3, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jade3Q6IE82 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Jade3Q6IE82 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Jade3Q6IE82 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Jade3Q6IE82 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Jade3Q6IE82 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Jade3Q6IE82 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Jade3Q6IE82 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Jade3Q6IE82 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Jade3Q6IE82 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Jade3Q6IE82 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Jade3Q6IE82 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Jade3Q6IE82 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Jade3Q6IE82 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Jade3Q6IE82 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Jade3Q6IE82 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Jade3Q6IE82 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Jade3Q6IE82 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Jade3Q6IE82 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Jade3Q6IE82 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Jade3Q6IE82 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Jade3Q6IE82 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Jade3Q6IE82 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Jade3Q6IE82 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Jade3Q6IE82 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Jade3Q6IE82 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Jade3Q6IE82 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Jade3Q6IE82 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Jade3Q6IE82 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Jade3Q6IE82 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Jade3Q6IE82 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Jade3Q6IE82 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Jade3Q6IE82 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Jade3Q6IE82 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Jade3Q6IE82 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Jade3Q6IE82 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Jade3Q6IE82 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Jade3Q6IE82 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Jade3Q6IE82 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Jade3Q6IE82 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Jade3Q6IE82 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Jade3Q6IE82 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Jade3Q6IE82 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Jade3Q6IE82 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Jade3Q6IE82 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Jade3Q6IE82 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Jade3Q6IE82 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Jade3Q6IE82 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Jade3Q6IE82 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Jade3Q6IE82 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Jade3Q6IE82 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Jade3Q6IE82 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Jade3Q6IE82 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Jade3Q6IE82 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Jade3Q6IE82 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Jade3Q6IE82 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Jade3Q6IE82 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Jade3Q6IE82 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Jade3Q6IE82 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Jade3Q6IE82 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Jade3Q6IE82 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Jade3Q6IE82 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Jade3Q6IE82 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Jade3Q6IE82 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Jade3Q6IE82 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Jade3Q6IE82 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Jade3Q6IE82 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Jade3Q6IE82 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Jade3Q6IE82 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Jade3Q6IE82 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Jade3Q6IE82 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Jade3Q6IE82 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Jade3Q6IE82 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Jade3Q6IE82 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Jade3Q6IE82 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Jade3Q6IE82 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Jade3Q6IE82 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Jade3Q6IE82 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Jade3Q6IE82 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Jade3Q6IE82 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Jade3Q6IE82 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Jade3Q6IE82 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Jade3Q6IE82 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Jade3Q6IE82 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Jade3Q6IE82 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Jade3Q6IE82 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Jade3Q6IE82 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Jade3Q6IE82 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Jade3Q6IE82 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Jade3Q6IE82 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Jade3Q6IE82 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Jade3Q6IE82 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Jade3Q6IE82 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Jade3Q6IE82 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Jade3Q6IE82 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Jade3Q6IE82 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Jade3Q6IE82 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Jade3Q6IE82 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Jade3Q6IE82 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Jade3Q6IE82 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Jade3Q6IE82 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms