Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
Capn12Q9ER56 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Capn12Q9ER56 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Capn12Q9ER56 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Capn12Q9ER56 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Capn12Q9ER56 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Capn12Q9ER56 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Capn12Q9ER56 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Capn12Q9ER56 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Capn12Q9ER56 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Capn12Q9ER56 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Capn12Q9ER56 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Capn12Q9ER56 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Capn12Q9ER56 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Capn12Q9ER56 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Capn12Q9ER56 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Capn12Q9ER56 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Capn12Q9ER56 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Capn12Q9ER56 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Capn12Q9ER56 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Capn12Q9ER56 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Capn12Q9ER56 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Capn12Q9ER56 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Capn12Q9ER56 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Capn12Q9ER56 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Capn12Q9ER56 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Capn12Q9ER56 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Capn12Q9ER56 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Capn12Q9ER56 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Capn12Q9ER56 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Capn12Q9ER56 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Capn12Q9ER56 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Capn12Q9ER56 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Capn12Q9ER56 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Capn12Q9ER56 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Capn12Q9ER56 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Capn12Q9ER56 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Capn12Q9ER56 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Capn12Q9ER56 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Capn12Q9ER56 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Capn12Q9ER56 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Capn12Q9ER56 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Capn12Q9ER56 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Capn12Q9ER56 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Capn12Q9ER56 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Capn12Q9ER56 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Capn12Q9ER56 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Capn12Q9ER56 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Capn12Q9ER56 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Capn12Q9ER56 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Capn12Q9ER56 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Capn12Q9ER56 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Capn12Q9ER56 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Capn12Q9ER56 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Capn12Q9ER56 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Capn12Q9ER56 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Capn12Q9ER56 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Capn12Q9ER56 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Capn12Q9ER56 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Capn12Q9ER56 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Capn12Q9ER56 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Capn12Q9ER56 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Capn12Q9ER56 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Capn12Q9ER56 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Capn12Q9ER56 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Capn12Q9ER56 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Capn12Q9ER56 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Capn12Q9ER56 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Capn12Q9ER56 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Capn12Q9ER56 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Capn12Q9ER56 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Capn12Q9ER56 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Capn12Q9ER56 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Capn12Q9ER56 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Capn12Q9ER56 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Capn12Q9ER56 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Capn12Q9ER56 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Capn12Q9ER56 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Capn12Q9ER56 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Capn12Q9ER56 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Capn12Q9ER56 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Capn12Q9ER56 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Capn12Q9ER56 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Capn12Q9ER56 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Capn12Q9ER56 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Capn12Q9ER56 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Capn12Q9ER56 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Capn12Q9ER56 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Capn12Q9ER56 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Capn12Q9ER56 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Capn12Q9ER56 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Capn12Q9ER56 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Capn12Q9ER56 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Capn12Q9ER56 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Capn12Q9ER56 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Capn12Q9ER56 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Capn12Q9ER56 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Capn12Q9ER56 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Capn12Q9ER56 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Capn12Q9ER56 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms