RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000076734.6

Scaf8-201, Transcript of Protein SCAF8, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Scaf8, Length 4,869 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Syde2E9PUP1 1314 aa20.37■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 TrhQ62361 256 aa20.37■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Pprc1Q6NZN1 1644 aa20.37■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 CebpzP53569 1052 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Gm45015A0A140LII9 184 aa20.36■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Gm18336A0A140LIU8 765 aa20.36■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Anxa1P10107 346 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Mrps25Q9D125 171 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Adora1Q60612 326 aa20.36■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Gle1Q8R322 699 aa20.36■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Cdcp1Q5U462 833 aa20.36■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Prdm1Q60636 856 aa20.36■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Ccdc73Q8CDM4 1066 aa20.36■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Smc1bQ920F6 1248 aa20.36■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Eid1Q9DCR4 169 aa20.36■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Cd274Q9EP73 290 aa20.36■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Pknox2Q8BG99 474 aa20.36■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Gas8Q60779 478 aa20.35■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Tsr2Q8C8T8 191 aa20.35■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Sass6Q80UK7 654 aa20.35■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Ccdc105Q9D4K7 499 aa20.35■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Plekhg1F6S200 1446 aa20.35■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Zbtb38Q3LR78 1197 aa20.35■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Dhx38Q80X98 1228 aa20.35■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Lrrc2Q8VDB8 371 aa20.35■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Psrc1Q9D0P7 329 aa20.35■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 InsrrQ9WTL4 1300 aa20.34■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Prdm11A2AGX3 565 aa20.34■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Eme2Q56A04 373 aa20.34■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Bin2D3Z6Q9 489 aa20.34■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 MthfslL7N466 203 aa20.34■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 LdhaP06151 332 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Kif5bQ61768 963 aa20.34■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 1700029H14RikE9PY36 240 aa20.33■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Nfil3O08750 462 aa20.33■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Kdm4cQ8VCD7 1054 aa20.33■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Adgrl1Q80TR1 1466 aa20.33■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Snx25Q3ZT31 840 aa20.33■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Ccdc83Q9D4V3 305 aa20.33■□□□□ 0.85
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Tpcn2Q8BWC0 731 aa20.33■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 SnrkQ8VDU5 748 aa20.33■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Erbb3Q61526 1339 aa20.33■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Cyp24a1Q64441 514 aa20.33■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Tut1Q8R3F9 869 aa20.33■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 SdsQ8VBT2 327 aa20.33■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Serpinc1P32261 465 aa20.32■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Chl1P70232 1209 aa20.32■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Zkscan4Q5SZT6 480 aa20.32■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Tcp11l1Q8BTG3 509 aa20.32■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Svs3aF2Z472 265 aa20.32■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 SsbP32067 415 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Ftl2P49945 183 aa20.32■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Adam1aQ60813 791 aa20.32■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Pde1cQ64338 706 aa20.32■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Nlrp1aQ2LKU9 1182 aa20.32■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Uba5Q8VE47 403 aa20.32■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa20.32■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Znf394Q9Z1D9 521 aa20.32■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Gm10378F6XQQ1 160 aa20.32■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Ttll12Q3UDE2 639 aa20.32■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Setdb1O88974 1307 aa20.31■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Gm4758L7N258 96 aa20.31■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Ubash3aQ3V3E1 624 aa20.31■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Exoc3Q6KAR6 755 aa20.31■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Arhgef18Q6P9R4 1021 aa20.31■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Nap1l4Q78ZA7 375 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Chmp6P0C0A3 200 aa20.31■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Ets1P27577 440 aa20.31■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Myl10Q62082 202 aa20.31■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Syce1Q9D495 329 aa20.31■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 AceP09470 1312 aa20.31■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 DesP31001 469 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Exoc8Q6PGF7 716 aa20.31■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Disp3A3KFU9 1347 aa20.31■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Atp2b1G5E829 1220 aa20.31■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Gm28047Q3US59 414 aa20.31■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Pex1Q5BL07 1284 aa20.31■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Taok3Q8BYC6 898 aa20.31■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa20.31■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Kif24Q6NWW5 1356 aa20.3■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Kiaa1024Q8K3V7 917 aa20.3■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Cfap65Q3V0B4 1847 aa20.3■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Parp1P11103 1013 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Zbtb40Q6PCS8 1258 aa20.3■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Plbd2Q3TCN2 594 aa20.3■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Ccdc113Q8C5T8 377 aa20.3■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Prl3d1P18121 224 aa20.3■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Hdhd2Q3UGR5 259 aa20.3■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Kif1bpQ6ZPU9 617 aa20.3■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Egfl6Q9JJZ5 550 aa20.3■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa20.29■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 E9QMW4 1145 aa20.29■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 EspnlQ3UYR4 1005 aa20.29■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Tmtc2Q56A06 836 aa20.29■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Mdh1bQ5F204 500 aa20.29■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Ccdc42Q5SV66 316 aa20.29■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 Map3k12Q60700 888 aa20.29■□□□□ 0.84
Scaf8-201ENSMUST00000076734 HmcesQ8R1M0 353 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11.4 ms