Protein–RNA interactions for Protein: Q61768

Kif5b, Kinesin-1 heavy chain, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5bQ61768 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
Kif5bQ61768 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Kif5bQ61768 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Kif5bQ61768 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Kif5bQ61768 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
Kif5bQ61768 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Kif5bQ61768 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Kif5bQ61768 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Kif5bQ61768 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Kif5bQ61768 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Kif5bQ61768 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Kif5bQ61768 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Kif5bQ61768 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Kif5bQ61768 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Kif5bQ61768 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Kif5bQ61768 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Kif5bQ61768 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Kif5bQ61768 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Kif5bQ61768 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Kif5bQ61768 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Kif5bQ61768 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Kif5bQ61768 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Kif5bQ61768 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Kif5bQ61768 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Kif5bQ61768 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Kif5bQ61768 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Kif5bQ61768 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Kif5bQ61768 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Kif5bQ61768 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Kif5bQ61768 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Kif5bQ61768 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Kif5bQ61768 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Kif5bQ61768 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Kif5bQ61768 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Kif5bQ61768 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Kif5bQ61768 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Kif5bQ61768 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Kif5bQ61768 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Kif5bQ61768 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kif5bQ61768 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Kif5bQ61768 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Kif5bQ61768 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Kif5bQ61768 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Kif5bQ61768 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Kif5bQ61768 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Kif5bQ61768 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Kif5bQ61768 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Kif5bQ61768 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Kif5bQ61768 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Kif5bQ61768 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Kif5bQ61768 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Kif5bQ61768 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Kif5bQ61768 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Kif5bQ61768 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Kif5bQ61768 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Kif5bQ61768 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Kif5bQ61768 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Kif5bQ61768 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Kif5bQ61768 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Kif5bQ61768 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Kif5bQ61768 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Kif5bQ61768 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Kif5bQ61768 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Kif5bQ61768 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Kif5bQ61768 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Kif5bQ61768 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Kif5bQ61768 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Kif5bQ61768 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Kif5bQ61768 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Kif5bQ61768 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Kif5bQ61768 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Kif5bQ61768 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Kif5bQ61768 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Kif5bQ61768 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Kif5bQ61768 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Kif5bQ61768 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Kif5bQ61768 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Kif5bQ61768 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Kif5bQ61768 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Kif5bQ61768 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Kif5bQ61768 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Kif5bQ61768 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Kif5bQ61768 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Kif5bQ61768 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Kif5bQ61768 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Kif5bQ61768 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Kif5bQ61768 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Kif5bQ61768 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Kif5bQ61768 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Kif5bQ61768 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Kif5bQ61768 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Kif5bQ61768 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Kif5bQ61768 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Kif5bQ61768 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Kif5bQ61768 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Kif5bQ61768 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Kif5bQ61768 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Kif5bQ61768 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Kif5bQ61768 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Kif5bQ61768 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms