Protein–RNA interactions for Protein: P32261

Serpinc1, Antithrombin-III, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinc1P32261 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
Serpinc1P32261 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Serpinc1P32261 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Serpinc1P32261 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Serpinc1P32261 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Serpinc1P32261 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Serpinc1P32261 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Serpinc1P32261 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Serpinc1P32261 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Serpinc1P32261 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Serpinc1P32261 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Serpinc1P32261 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Serpinc1P32261 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Serpinc1P32261 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Serpinc1P32261 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Serpinc1P32261 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Serpinc1P32261 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Serpinc1P32261 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Serpinc1P32261 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Serpinc1P32261 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Serpinc1P32261 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Serpinc1P32261 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Serpinc1P32261 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Serpinc1P32261 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Serpinc1P32261 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Serpinc1P32261 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Serpinc1P32261 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Serpinc1P32261 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Serpinc1P32261 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Serpinc1P32261 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Serpinc1P32261 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Serpinc1P32261 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Serpinc1P32261 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Serpinc1P32261 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Serpinc1P32261 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Serpinc1P32261 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Serpinc1P32261 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Serpinc1P32261 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Serpinc1P32261 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Serpinc1P32261 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Serpinc1P32261 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Serpinc1P32261 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Serpinc1P32261 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Serpinc1P32261 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Serpinc1P32261 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Serpinc1P32261 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Serpinc1P32261 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Serpinc1P32261 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Serpinc1P32261 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Serpinc1P32261 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Serpinc1P32261 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Serpinc1P32261 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Serpinc1P32261 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Serpinc1P32261 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Serpinc1P32261 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Serpinc1P32261 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Serpinc1P32261 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Serpinc1P32261 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Serpinc1P32261 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Serpinc1P32261 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Serpinc1P32261 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Serpinc1P32261 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Serpinc1P32261 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Serpinc1P32261 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Serpinc1P32261 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Serpinc1P32261 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Serpinc1P32261 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Serpinc1P32261 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Serpinc1P32261 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Serpinc1P32261 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Serpinc1P32261 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Serpinc1P32261 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Serpinc1P32261 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Serpinc1P32261 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Serpinc1P32261 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Serpinc1P32261 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Serpinc1P32261 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Serpinc1P32261 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Serpinc1P32261 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Serpinc1P32261 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Serpinc1P32261 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Serpinc1P32261 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Serpinc1P32261 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Serpinc1P32261 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Serpinc1P32261 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Serpinc1P32261 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Serpinc1P32261 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Serpinc1P32261 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Serpinc1P32261 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Serpinc1P32261 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Serpinc1P32261 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Serpinc1P32261 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Serpinc1P32261 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Serpinc1P32261 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Serpinc1P32261 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Serpinc1P32261 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Serpinc1P32261 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Serpinc1P32261 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Serpinc1P32261 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Serpinc1P32261 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.1 ms