RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027009.10

Casp12-201, Transcript of Caspase-12, mouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casp12, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tab3	Q571K4	716 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Trak1	Q6PD31	939 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tcp10a	Q80W76	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Vac14	Q80WQ2	782 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sh3bgrl2	Q8BG73	107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mfsd6	Q8CBH5	775 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prpf3	Q922U1	683 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Upf1	Q9EPU0	1124 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Arhgef7	Q9ES28	862 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ror1	Q9Z139	937 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm42641	I6L9G2	585 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Bin1	O08539	588 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kif3c	O35066	796 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Clec11a	O88200	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ppfia3	P60469	1194 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Alkbh5	Q3TSG4	395 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Spg7	Q3ULF4	781 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Eif1a	Q60872	144 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tbata	Q7TSD4	393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Wnk4	Q80UE6	1222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Wbp1l	Q8BGW2	348 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Atrip	Q8BMG1	785 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Eif1ax	Q8BMJ3	144 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tsr2	Q8C8T8	191 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pcdhgc3	Q91XX1	934 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hhipl2	Q9D2G9	717 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cwc25	Q9DBF7	416 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam124a	D3Z5V4	536 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm28043	E0CXC2	719 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam184a	E9PW83	1143 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tigd5	Q499M4	642 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Deptor	Q570Y9	409 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hells	Q60848	821 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Scube3	Q66PY1	993 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Man1c1	Q6NXK9	625 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Snx32	Q80ZJ7	404 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Psapl1	Q8C1C1	522 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Optn	Q8K3K8	584 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kif2c	Q922S8	721 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccdc43	Q9CR29	222 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rfc5	Q9D0F6	339 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gtf2i	Q9ESZ8	998 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Efcc1	Q9JJF6	558 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Spast	Q9QYY8	614 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sel1l	Q9Z2G6	790 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm11758	A2BEI6	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm11757	A2BEI8	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm382	B1AXN3	1250 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dgkh	D3YXJ0	1156 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm8267	E9Q207	261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm11239	E9Q5Z9	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm11237	F2Z3W5	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm11238	F2Z478	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm11236	J3QMS7	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zfp850	J3QPC5	689 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pik3ca	P42337	1068 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pura	P42669	321 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kcna2	P63141	499 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cct5	P80316	541 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm428	Q3UTE2	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam71b	Q5STT6	665 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Itga6	Q61739	1091 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Wapl	Q65Z40	1200 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Isy1	Q69ZQ2	285 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ddx58	Q6Q899	926 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccdc116	Q80X53	541 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Spock3	Q8BKV0	436 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Catsper4	Q8BVN3	442 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Anapc4	Q91W96	807 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Il20	Q9JKV9	176 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tcof1	O08784	1320 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cep164	Q5DU05	1446 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ankrd34a	B2RW11	495 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm3618	D3Z4P5	127 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	A930017K11Rik	E0CXQ2	571 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cald1	E9QA15	768 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Epb41l2	O70318	988 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccr5	P51682	354 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Egfr	Q01279	1210 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cnnm2	Q3TWN3	875 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tbc1d9	Q3UYK3	1264 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Xpa	Q64267	272 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nifk	Q91VE6	317 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fibp	Q9JI19	357 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Smpd5	D6MZJ6	483 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zfpm1	O35615	995 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fxn	O35943	207 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ptprc	P06800	1291 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Impdh2	P24547	514 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Exosc10	P56960	887 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cops2	P61202	443 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ksr1	Q61097	873 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prkg2	Q61410	762 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Foxj1	Q61660	421 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dennd2c	Q6P9P8	914 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fez2	Q6TYB5	348 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmc6	Q7TN60	810 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccp110	Q7TSH4	1004 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lrrc27	Q80YS5	523 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zkscan1	Q8BGS3	561 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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