Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sh3bgrl2Q8BG73 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Sh3bgrl2Q8BG73 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sh3bgrl2Q8BG73 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Sh3bgrl2Q8BG73 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sh3bgrl2Q8BG73 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Sh3bgrl2Q8BG73 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sh3bgrl2Q8BG73 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sh3bgrl2Q8BG73 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sh3bgrl2Q8BG73 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sh3bgrl2Q8BG73 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh3bgrl2Q8BG73 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Sh3bgrl2Q8BG73 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sh3bgrl2Q8BG73 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh3bgrl2Q8BG73 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sh3bgrl2Q8BG73 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh3bgrl2Q8BG73 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh3bgrl2Q8BG73 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh3bgrl2Q8BG73 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3bgrl2Q8BG73 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh3bgrl2Q8BG73 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3bgrl2Q8BG73 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sh3bgrl2Q8BG73 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3bgrl2Q8BG73 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3bgrl2Q8BG73 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh3bgrl2Q8BG73 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sh3bgrl2Q8BG73 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sh3bgrl2Q8BG73 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh3bgrl2Q8BG73 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh3bgrl2Q8BG73 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh3bgrl2Q8BG73 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3bgrl2Q8BG73 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3bgrl2Q8BG73 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bgrl2Q8BG73 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3bgrl2Q8BG73 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3bgrl2Q8BG73 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh3bgrl2Q8BG73 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3bgrl2Q8BG73 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3bgrl2Q8BG73 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bgrl2Q8BG73 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bgrl2Q8BG73 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh3bgrl2Q8BG73 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3bgrl2Q8BG73 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3bgrl2Q8BG73 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3bgrl2Q8BG73 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bgrl2Q8BG73 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bgrl2Q8BG73 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bgrl2Q8BG73 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bgrl2Q8BG73 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bgrl2Q8BG73 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bgrl2Q8BG73 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bgrl2Q8BG73 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bgrl2Q8BG73 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bgrl2Q8BG73 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bgrl2Q8BG73 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bgrl2Q8BG73 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bgrl2Q8BG73 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bgrl2Q8BG73 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sh3bgrl2Q8BG73 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bgrl2Q8BG73 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bgrl2Q8BG73 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3bgrl2Q8BG73 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms