Protein–RNA interactions for Protein: P42669

Pura, Transcriptional activator protein Pur-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PuraP42669 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.32■■■■■ 4.53
PuraP42669 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
PuraP42669 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
PuraP42669 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
PuraP42669 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
PuraP42669 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
PuraP42669 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PuraP42669 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PuraP42669 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PuraP42669 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
PuraP42669 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PuraP42669 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PuraP42669 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PuraP42669 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PuraP42669 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
PuraP42669 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PuraP42669 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PuraP42669 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PuraP42669 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PuraP42669 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PuraP42669 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PuraP42669 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PuraP42669 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PuraP42669 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
PuraP42669 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PuraP42669 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PuraP42669 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PuraP42669 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
PuraP42669 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PuraP42669 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PuraP42669 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PuraP42669 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PuraP42669 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
PuraP42669 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PuraP42669 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PuraP42669 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PuraP42669 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PuraP42669 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PuraP42669 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PuraP42669 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PuraP42669 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PuraP42669 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PuraP42669 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
PuraP42669 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PuraP42669 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
PuraP42669 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PuraP42669 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PuraP42669 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PuraP42669 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PuraP42669 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PuraP42669 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
PuraP42669 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
PuraP42669 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
PuraP42669 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PuraP42669 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PuraP42669 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PuraP42669 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PuraP42669 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PuraP42669 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PuraP42669 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PuraP42669 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PuraP42669 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PuraP42669 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
PuraP42669 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PuraP42669 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PuraP42669 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PuraP42669 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PuraP42669 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PuraP42669 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PuraP42669 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PuraP42669 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
PuraP42669 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PuraP42669 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PuraP42669 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PuraP42669 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PuraP42669 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PuraP42669 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PuraP42669 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PuraP42669 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PuraP42669 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PuraP42669 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PuraP42669 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PuraP42669 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.65
PuraP42669 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PuraP42669 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PuraP42669 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PuraP42669 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PuraP42669 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PuraP42669 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PuraP42669 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PuraP42669 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PuraP42669 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PuraP42669 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
PuraP42669 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PuraP42669 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PuraP42669 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PuraP42669 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PuraP42669 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PuraP42669 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
PuraP42669 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms