Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV0

Spock3, Testican-3, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock3Q8BKV0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Spock3Q8BKV0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Spock3Q8BKV0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Spock3Q8BKV0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Spock3Q8BKV0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spock3Q8BKV0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Spock3Q8BKV0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Spock3Q8BKV0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spock3Q8BKV0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Spock3Q8BKV0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Spock3Q8BKV0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Spock3Q8BKV0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Spock3Q8BKV0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Spock3Q8BKV0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spock3Q8BKV0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spock3Q8BKV0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spock3Q8BKV0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Spock3Q8BKV0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spock3Q8BKV0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Spock3Q8BKV0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Spock3Q8BKV0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spock3Q8BKV0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spock3Q8BKV0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spock3Q8BKV0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spock3Q8BKV0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spock3Q8BKV0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Spock3Q8BKV0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spock3Q8BKV0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spock3Q8BKV0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spock3Q8BKV0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spock3Q8BKV0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spock3Q8BKV0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Spock3Q8BKV0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spock3Q8BKV0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spock3Q8BKV0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Spock3Q8BKV0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spock3Q8BKV0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spock3Q8BKV0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Spock3Q8BKV0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spock3Q8BKV0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spock3Q8BKV0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spock3Q8BKV0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spock3Q8BKV0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spock3Q8BKV0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spock3Q8BKV0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spock3Q8BKV0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spock3Q8BKV0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spock3Q8BKV0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spock3Q8BKV0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spock3Q8BKV0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spock3Q8BKV0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Spock3Q8BKV0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spock3Q8BKV0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Spock3Q8BKV0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spock3Q8BKV0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spock3Q8BKV0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spock3Q8BKV0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spock3Q8BKV0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spock3Q8BKV0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spock3Q8BKV0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spock3Q8BKV0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spock3Q8BKV0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Spock3Q8BKV0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Spock3Q8BKV0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spock3Q8BKV0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spock3Q8BKV0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spock3Q8BKV0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Spock3Q8BKV0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spock3Q8BKV0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spock3Q8BKV0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spock3Q8BKV0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spock3Q8BKV0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Spock3Q8BKV0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spock3Q8BKV0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spock3Q8BKV0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spock3Q8BKV0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spock3Q8BKV0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Spock3Q8BKV0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spock3Q8BKV0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spock3Q8BKV0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spock3Q8BKV0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spock3Q8BKV0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spock3Q8BKV0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spock3Q8BKV0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spock3Q8BKV0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spock3Q8BKV0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spock3Q8BKV0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spock3Q8BKV0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spock3Q8BKV0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spock3Q8BKV0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spock3Q8BKV0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spock3Q8BKV0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spock3Q8BKV0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spock3Q8BKV0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Spock3Q8BKV0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Spock3Q8BKV0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spock3Q8BKV0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spock3Q8BKV0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Spock3Q8BKV0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spock3Q8BKV0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms