RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000003554.10

Casq1-201, Transcript of Calsequestrin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casq1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1-201ENSMUST00000003554 Q9D9S1 216 aa19.17■□□□□ 0.66
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gdf11Q9Z1W4 405 aa19.17■□□□□ 0.66
Casq1-201ENSMUST00000003554 Frmpd3A0A140LIW3 1774 aa19.17■□□□□ 0.66
Casq1-201ENSMUST00000003554 F2rP30558 430 aa19.16■□□□□ 0.66
Casq1-201ENSMUST00000003554 Krt40Q6IFX3 439 aa19.16■□□□□ 0.66
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tmem67Q8BR76 992 aa19.16■□□□□ 0.66
Casq1-201ENSMUST00000003554 OscarQ8VBT3 265 aa19.16■□□□□ 0.66
Casq1-201ENSMUST00000003554 WaslQ91YD9 501 aa19.16■□□□□ 0.66
Casq1-201ENSMUST00000003554 Psma5Q9Z2U1 241 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ercc3P49135 783 aa19.16■□□□□ 0.66
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pkp1P97350 728 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
Casq1-201ENSMUST00000003554 Shisa4Q8CA71 197 aa19.16■□□□□ 0.66
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tceanc2Q8R2M0 207 aa19.16■□□□□ 0.66
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tbc1d7Q9D0K0 293 aa19.16■□□□□ 0.66
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rufy3Q9D394 469 aa19.16■□□□□ 0.66
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dmrtc1Q9D9R7 182 aa19.16■□□□□ 0.66
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tbc1d8Q9Z1A9 1134 aa19.16■□□□□ 0.66
Casq1-201ENSMUST00000003554 Carmil3Q3UFQ8 1375 aa19.16■□□□□ 0.66
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zfp831A2ADM8 1628 aa19.15■□□□□ 0.66
Casq1-201ENSMUST00000003554 Itgb4A2A863 1818 aa19.15■□□□□ 0.66
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cyp24a1Q64441 514 aa19.15■□□□□ 0.66
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfm5Q8BU90 496 aa19.15■□□□□ 0.66
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tango6Q8C3S2 1079 aa19.15■□□□□ 0.66
Casq1-201ENSMUST00000003554 Alx1Q8C8B0 326 aa19.15■□□□□ 0.66
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slc51aQ8R000 340 aa19.15■□□□□ 0.66
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mast3Q3U214 1321 aa19.15■□□□□ 0.66
Casq1-201ENSMUST00000003554 Chd5A2A8L1 1946 aa19.14■□□□□ 0.66
Casq1-201ENSMUST00000003554 Irgm2A0A140LIF8 407 aa19.14■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rps6kb1Q8BSK8 525 aa19.14■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 NsmfQ99NF2 532 aa19.14■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cyp2ab1S4R196 498 aa19.14■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Usp42B2RQC2 1324 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Nrxn2E9Q7X7 1710 aa19.14■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fbxl16A2RT62 479 aa19.14■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Casq1O09165 405 aa19.14■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Spg7Q3ULF4 781 aa19.14■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Hand2Q61039 217 aa19.14■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 PnnO35691 725 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Filip1lQ6P6L0 1131 aa19.13■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ces1dQ8VCT4 565 aa19.13■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mrpl50Q8VDT9 159 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Btaf1E9QAE3 1848 aa19.13■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Chrna5Q2MKA5 467 aa19.12■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 SfswapQ3USH5 945 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Spty2d1Q68FG3 682 aa19.12■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cfap69Q8BH53 942 aa19.12■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pof1bQ8K4L4 587 aa19.12■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pold4Q9CWP8 107 aa19.12■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Trpc5Q9QX29 975 aa19.12■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 NesQ6P5H2 1864 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 1700006A11RikB9EHI3 544 aa19.11■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Csrnp1P59054 583 aa19.11■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ccdc158Q8CDI6 1109 aa19.11■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cchcr1Q8K2I2 770 aa19.11■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 RarsQ9D0I9 660 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cxcl11Q9JHH5 100 aa19.11■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Lmnb1P14733 588 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Atp6v1dP57746 247 aa19.11■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 IarsQ8BU30 1262 aa19.11■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Elmsan1E9Q2I4 1089 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 CrcpO35427 148 aa19.1■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slc44a4Q91VA1 707 aa19.1■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Myh2G3UW82 1942 aa19.1■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slc4a4O88343 1079 aa19.09■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Atp6v1aP50516 617 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dynll1P63168 89 aa19.09■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Acap3Q6NXL5 833 aa19.09■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Atad2Q8CDM1 1040 aa19.09■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rbm43Q99J64 343 aa19.09■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Atp2b4Q6Q477 1205 aa19.09■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 ImmtQ8CAQ8 757 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Trmt44Q9D2Q2 713 aa19.09■□□□□ 0.65
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cyp2d34L7N463 504 aa19.08■□□□□ 0.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rsph3aQ3UFY4 516 aa19.08■□□□□ 0.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 Kif22Q3V300 660 aa19.08■□□□□ 0.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ddx19aQ61655 478 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 WdpcpQ8C456 722 aa19.08■□□□□ 0.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 CpdO89001 1377 aa19.08■□□□□ 0.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 VirmaA2AIV2 1811 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 Scn9aQ62205 1984 aa19.07■□□□□ 0.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 Syt1P46096 421 aa19.07■□□□□ 0.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gnat2P50149 354 aa19.07■□□□□ 0.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cdcp1Q5U462 833 aa19.07■□□□□ 0.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 Insm1Q63ZV0 521 aa19.07■□□□□ 0.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm21985Q6P6P5 1106 aa19.07■□□□□ 0.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tmem179Q8BHH9 233 aa19.07■□□□□ 0.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 1700018B08RikQ9DA83 213 aa19.07■□□□□ 0.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm3893E9Q1I1 302 aa19.07■□□□□ 0.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 NapbP28663 298 aa19.07■□□□□ 0.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 Exosc10P56960 887 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 Kif20aP97329 887 aa19.07■□□□□ 0.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 Uba5Q8VE47 403 aa19.07■□□□□ 0.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cnot6lQ8VEG6 555 aa19.07■□□□□ 0.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 Adgra3Q7TT36 1310 aa19.07■□□□□ 0.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 EgfrQ01279 1210 aa19.06■□□□□ 0.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 GapdhsQ64467 440 aa19.06■□□□□ 0.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pdzph1Q8BGR1 1238 aa19.06■□□□□ 0.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zkscan1Q8BGS3 561 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 Eaf2Q91ZD6 262 aa19.06■□□□□ 0.64
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gdpd2Q9ESM6 539 aa19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.2 ms