RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 NUP50Q9UKX7 468 aa9.6□□□□□ -0.87
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CAPNS1-209ENST00000590049 PAHP00439 452 aa9.59□□□□□ -0.87
CAPNS1-209ENST00000590049 CD37P11049 281 aa9.59□□□□□ -0.87
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CAPNS1-209ENST00000590049 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa9.56□□□□□ -0.88
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CAPNS1-209ENST00000590049 IGKV1D-12P01611 117 aa9.56□□□□□ -0.88
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CAPNS1-209ENST00000590049 LYNX1P0DP58 116 aa9.56□□□□□ -0.88
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CAPNS1-209ENST00000590049 OR10K2Q6IF99 312 aa9.56□□□□□ -0.88
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