RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562443.1

CFAP20-202, Transcript of cilia and flagella associated protein 20, humanhuman

TSL 5

Gene CFAP20, Length 276 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20-202ENST00000562443 LY6HO94772 140 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 DIRAS3O95661 229 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 PRM1P04553 51 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 SERPINA7P05543 415 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 CTSEP14091 401 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 GABRA1P14867 456 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 FUT1P19526 365 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 NT5EP21589 574 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 LAP3P28838 519 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 PFN2P35080 140 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 SPRR2BP35325 72 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 VHLP40337 213 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 PPICP45877 212 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 SERPINB9P50453 376 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 AQP4P55087 323 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 MTPNP58546 118 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 KIAA1024LP59773 190 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 ACTR1AP61163 376 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 RBP5P82980 135 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 PSG9Q00887 426 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 KDSRQ06136 332 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 APOFQ13790 326 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 PDK4Q16654 411 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 HADHQ16836 314 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 NDUFAF6Q330K2 333 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 GLRA4Q5JXX5 417 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 PPM1LQ5SGD2 360 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 ETFRF1Q6IPR1 90 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 TMEM220Q6QAJ8 160 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 ISLR2Q6UXK2 745 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 CLEC20AQ6ZU45 233 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 CTAGE6Q86UF2 777 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 CYP4Z1Q86W10 505 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 PRR15Q8IV56 129 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 KIF2BQ8N4N8 673 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 TRIML2Q8N7C3 387 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 FAM71CQ8NEG0 241 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 OR9K2Q8NGE7 335 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 OR10A6Q8NH74 314 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 TWIST2Q8WVJ9 160 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 OR5P2Q8WZ92 322 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 MAL2Q969L2 176 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 CMBLQ96DG6 245 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 SLC38A2Q96QD8 506 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 AP1M1Q9BXS5 423 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 MEAF6Q9HAF1 191 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 TRIM10Q9UDY6 481 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 PIGLQ9Y2B2 252 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 STARD10Q9Y365 291 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 WASHC3Q9Y3C0 194 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 LINC00588Q9Y4M8 146 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 GMEB1Q9Y692 573 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 COL18A1P39060 1754 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa-0.63□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 SETD5Q9C0A6 1442 aa-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 MUC17Q685J3 4493 aa-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 ACACAQ13085 2346 aa-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 NINQ8N4C6 2090 aa-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 CUX2O14529 1486 aa-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 LOC100653049A0A140TA62 436 aa-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 SLC5A10A0PJK1 596 aa-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 TRIM64A6NGJ6 449 aa-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 TRIM64BA6NI03 449 aa-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 C9J4A7 227 aa-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 SMKR1H3BMG3 65 aa-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 SLC37A4O43826 429 aa-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 SSX5O60225 188 aa-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 HYPMO75409 117 aa-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 B3GALNT1O75752 331 aa-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 IDH1O75874 414 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 OR2J3O76001 311 aa-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 KRT34O76011 436 aa-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 CLDN9O95484 217 aa-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 DNAL4O96015 105 aa-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 C1QAP02745 245 aa-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 SERPINA5P05154 406 aa-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 PGA4P0DJD7 388 aa-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 PGA3P0DJD8 388 aa-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 SCGB1C2P0DMR2 95 aa-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 CT45A6P0DMU7 189 aa-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 CT45A5P0DMU8 189 aa-0.64□□□□□ -2.51
CFAP20-202ENST00000562443 CT45A7P0DMV0 189 aa-0.64□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms