RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545193.5

GRSF1-208, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GRSF1, Length 2,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-208	ENST00000545193	EHF	Q9NZC4	300 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	LAMA5	O15230	3695 aa		13.5	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	AKAP13	Q12802	2813 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	SFTA3	P0C7M3	94 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	CD80	P33681	288 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	TECTB	Q96PL2	329 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	13.49	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	STARD10	Q9Y365	291 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	ASCL4	Q6XD76	172 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193		Q96M66	194 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	PECR	Q9BY49	303 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	BIN3	Q9NQY0	253 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		13.49	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	GABRR1	P24046	479 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	APLNR	P35414	380 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	GUSBP1	Q15486	140 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	AVPI1	Q5T686	147 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	MDP1	Q86V88	176 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	AQP10	Q96PS8	301 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	FPR2	P25090	351 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	CAV2	P51636	162 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	POC1A	Q8NBT0	407 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	NAXE	Q8NCW5	288 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	C2orf50	Q96LR7	162 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		13.48	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	IGKV1D-12	P01611	117 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	IGHV1-2	P23083	117 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	MED12L	Q86YW9	2145 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	SERPINE3	A8MV23	424 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	FABP1	P07148	127 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	WNT5A	P41221	380 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	TGFBR3	Q03167	851 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	NANP	Q8TBE9	248 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	SMIM8	Q96KF7	97 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	EDAR	Q9UNE0	448 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF205	O95201	554 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	CBR1	P16152	277 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	ARL6IP1	Q15041	203 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	PEA15	Q15121	130 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		13.47	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	LYZL6	O75951	148 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	HKR1	P10072	659 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	PRDX4	Q13162	271 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	TAF9	Q16594	264 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	ACTBL2	Q562R1	376 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193		Q6ZT83	130 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	CALHM1	Q8IU99	346 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GRSF1-208	ENST00000545193	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		13.46	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	OR8U9	P0C7N5	309 aa		13.46	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	LYL1	P12980	280 aa		13.46	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	PTGER4	P35408	488 aa		13.46	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	F2RL1	P55085	397 aa		13.46	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		13.46	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193		Q6ZS92	163 aa		13.46	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	OR8U1	Q8NH10	309 aa		13.46	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		13.46	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	DOCK7	Q96N67	2140 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193		A0A1W2PR80	420 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	NUDT19	A8MXV4	375 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	AHRR	A9YTQ3	701 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	SPINK2	P20155	84 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
GRSF1-208	ENST00000545193	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		13.45	□□□□□ -0.26

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