RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513095.5

SH3BP2-226, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP2, Length 609 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-226ENST00000513095 Q8N7P7 452 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 OR4M1Q8NGD0 313 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 SLC6A7Q99884 636 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 ING4Q9UNL4 249 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 LRRC42Q9Y546 428 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 M0R1W7 72 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 SIRPB1O00241 398 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 TCF21O43680 179 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 HTR3BO95264 441 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 UCHL1P09936 223 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 LMO1P25800 156 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 OR3A1P47881 315 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 BMXP51813 675 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 TRAM1Q15629 374 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 GRK1Q15835 563 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 TUSC1Q2TAM9 212 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 HSD17B12Q53GQ0 312 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 GPR157Q5UAW9 335 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 TMEM200BQ69YZ2 307 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 GDPD3Q7L5L3 318 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 VMO1Q7Z5L0 202 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 CDH26Q8IXH8 852 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 BPIFB2Q8N4F0 458 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 JAGN1Q8N5M9 183 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 OR4S1Q8NGB4 309 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 OR51T1Q8NGJ9 327 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 OR5D13Q8NGL4 314 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 PHYHIPQ92561 330 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 LHX4Q969G2 390 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 MUL1Q969V5 352 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 CHST6Q9GZX3 395 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 METTL9Q9H1A3 318 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 IL36GQ9NZH8 169 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 A0A0G2JK05 382 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 MEGF11A6BM72 1044 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 DEGS1O15121 323 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 ZNF44P15621 663 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 SRMP19623 302 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 DLX1P56177 255 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 EDDM3BP56851 147 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 SCN1BQ07699 218 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 EDDM3AQ14507 147 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 ZNF273Q14593 569 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 SSX1Q16384 188 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 UBE2UQ5VVX9 321 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 ZNF773Q6PK81 442 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 BRD3OSQ6XYD6 125 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 C9orf139Q6ZV77 190 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 LRRTM1Q86UE6 522 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 NKAIN3Q8N8D7 197 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 TBC1D15Q8TC07 691 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 S100A13Q99584 98 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 TCF7L1Q9HCS4 588 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 SIRT7Q9NRC8 400 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 A0A0A6YYJ9 748 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 MGST3O14880 152 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 VENTXO95231 258 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 CCL3L1P16619 93 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 GABRA5P31644 462 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 BPIFB3P59826 476 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 FABP5Q01469 135 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 BLMHQ13867 455 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 IL13RA2Q14627 380 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 PIGYQ3MUY2 71 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 KCTD21Q4G0X4 260 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 SLC22A6Q4U2R8 563 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 USP43Q70EL4 1123 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 PDZD9Q8IXQ8 264 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 OSR2Q8N2R0 312 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 C11orf42Q8N5U0 333 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 TPRX1Q8N7U7 411 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 CHST4Q8NCG5 386 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 OR4D6Q8NGJ1 314 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 PPP1R35Q8TAP8 253 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 TNFRSF14Q92956 283 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 SUCNR1Q9BXA5 334 aa11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 A0A1W2PP11 408 aa11.6□□□□□ -0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 A0A1W2PPH5 198 aa11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.7 ms