RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 PRSS22Q9GZN4 317 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 NIPAL2Q9H841 368 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 HES4Q9HCC6 221 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 RASL12Q9NYN1 266 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 COPS3Q9UNS2 423 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 GMPPBQ9Y5P6 360 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 COL7A1Q02388 2944 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 DSCAML1Q8TD84 2053 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 A0A0U1RQV5 110 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 PQLC2LA1A4F0 135 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ARRDC5A6NEK1 342 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 A6NIN4 97 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 OR5B21A6NL26 309 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 F8VVB4 439 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 F8VWA3 439 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 J3QT63 122 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 CLIC3O95833 236 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 DYNLT3P51808 116 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ERVK11-1P61568 191 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 C6orf141Q5SZD1 244 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF691Q5VV52 312 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 SATL1Q86VE3 508 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 CALHM1Q8IU99 346 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 CPOQ8IVL8 374 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 BVESQ8NE79 360 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 OR5AU1Q8NGC0 362 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 OR11H6Q8NGC7 330 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 FAM81AQ8TBF8 368 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 OR51E1Q8TCB6 317 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 RPS4Y2Q8TD47 263 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 MALSU1Q96EH3 234 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 MBOAT4Q96T53 435 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 FEVQ99581 238 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 TTTY10Q9BZA0 68 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 PBOV1Q9GZY1 135 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 GPR84Q9NQS5 396 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 INPP5EQ9NRR6 644 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 GPR173Q9NS66 373 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 OR14J1Q9UGF5 321 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 PIGLQ9Y2B2 252 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 TPRKBQ9Y3C4 175 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 SNX5Q9Y5X3 404 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1B0GTI1 187 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC182A6NF36 153 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 FAM90A22PA8MWA6 464 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 K7N7A8 449 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 SLC1A7O00341 560 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 MPZL2O60487 215 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF737O75373 536 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 MMP23AO75900 390 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 NRASP01111 189 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 TTRP02766 147 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF728P0DKX0 622 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 IGHV1-8P0DP01 117 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 CD24P25063 80 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 HAAOP46952 286 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 CXCR4P61073 352 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 CDK5Q00535 292 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 COL10A1Q03692 680 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 LSAMPQ13449 338 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 GINS1Q14691 196 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 SMIM21Q3B7S5 101 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 DEFB121Q5J5C9 76 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM236Q5W0B7 351 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM42Q69YG0 159 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 GPR141Q7Z602 305 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 KRT77Q7Z794 578 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ANGPTL5Q86XS5 388 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 TPRX1Q8N7U7 411 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 TEX47Q8TBZ9 253 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 MYDGFQ969H8 173 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 ABCB10Q9NRK6 738 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 IMPAD1Q9NX62 359 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 HILPDAQ9Y5L2 63 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 CEPT1Q9Y6K0 416 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXD8-202ENST00000429017 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1W2PPH5 198 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 ACOD1A6NK06 481 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 H3BN98 237 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 PRODHO43272 600 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.3 ms