RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561524.5

KIFC3-208, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 577 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-208	ENST00000561524	PEX2	P28328	305 aa		13.53	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		13.53	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	C11orf88	Q6PI97	169 aa		13.53	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		13.53	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		13.53	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		13.53	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		13.53	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		13.53	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	C17orf50	Q8WW18	174 aa		13.53	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	RDH12	Q96NR8	316 aa		13.53	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	SLC29A1	Q99808	456 aa		13.53	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF649	Q9BS31	505 aa		13.53	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	ALG8	Q9BVK2	526 aa		13.53	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		13.53	□□□□□ -0.24
KIFC3-208	ENST00000561524	hADV38S2	A0JD32	116 aa		13.52	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	TMEM82	A0PJX8	343 aa		13.52	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524		M0QZ24	198 aa		13.52	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		13.52	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	KIR2DS4	P43632	304 aa		13.52	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	NPBWR2	P48146	333 aa		13.52	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	EDDM3B	P56851	147 aa		13.52	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	KRTAP10-3	P60369	221 aa		13.52	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		13.52	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		13.52	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		13.52	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		13.52	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		13.52	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	MALSU1	Q96EH3	234 aa		13.52	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF714	Q96N38	554 aa		13.52	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	HMG20A	Q9NP66	347 aa		13.52	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		13.52	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		13.52	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		13.52	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		13.52	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	VWF	P04275	2813 aa		13.51	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	TMEM212	A6NML5	194 aa		13.51	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	ODF3B	A8MYP8	253 aa		13.51	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	MGST3	O14880	152 aa		13.51	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	OCM2	P0CE71	109 aa		13.51	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	BCL3	P20749	454 aa		13.51	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	LMO1	P25800	156 aa		13.51	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	KLHL22	Q53GT1	634 aa		13.51	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	LPCAT4	Q643R3	524 aa		13.51	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF626	Q68DY1	528 aa		13.51	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		13.51	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		13.51	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		13.51	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	JAM3	Q9BX67	310 aa		13.51	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	PPA2	Q9H2U2	334 aa		13.51	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		13.51	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	AASS	Q9UDR5	926 aa		13.51	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		13.51	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		13.51	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	SH2D1B	O14796	132 aa		13.5	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	PSPN	O60542	156 aa		13.5	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	KDM4B	O94953	1096 aa		13.5	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	CCDC159	P0C7I6	412 aa		13.5	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	POU3F4	P49335	361 aa		13.5	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	BMX	P51813	675 aa		13.5	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	GRK1	Q15835	563 aa		13.5	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		13.5	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	TCF23	Q7RTU1	214 aa		13.5	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		13.5	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		13.5	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		13.5	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	PIFO	Q8TCI5	191 aa		13.5	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		13.5	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	MMP27	Q9H306	513 aa		13.5	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		13.5	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		13.5	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	FUOM	A2VDF0	154 aa		13.49	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	INMT	O95050	263 aa		13.49	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	ZFPL1	O95159	310 aa		13.49	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	PRKACA	P17612	351 aa		13.49	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	COX7A1	P24310	79 aa		13.49	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	DYNLT3	P51808	116 aa		13.49	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		13.49	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		13.49	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		13.49	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		13.48	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	IGKV1D-12	P01611	117 aa		13.48	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	ARG1	P05089	322 aa		13.48	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	CSN2	P05814	226 aa		13.48	□□□□□ -0.25
KIFC3-208	ENST00000561524	GABRR1	P24046	479 aa		13.48	□□□□□ -0.25

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