RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	OPA3	Q9H6K4	179 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	HSPG2	P98160	4391 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	C12orf77	C9JDV5	145 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF878	C9JN71	531 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	FXYD1	O00168	92 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	NXPH2	O95156	264 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	IFNA6	P05013	189 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	CALCB	P10092	127 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	ARSB	P15848	533 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM11	P17152	192 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	SELENOW	P63302	87 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	FOXE3	Q13461	319 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	IL18R1	Q13478	541 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	HES1	Q14469	280 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	COMMD1	Q8N668	190 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	LZIC	Q8WZA0	190 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	LEAP2	Q969E1	77 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	IFT27	Q9BW83	186 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	HES4	Q9HCC6	221 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A1B0GVY2	172 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A1W2PPI3	338 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651		A6NIN4	97 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	LEUTX	A8MZ59	168 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGKV1D-33	P01593	117 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGKV1-33	P01594	117 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	CDK2	P24941	298 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	PSMB8	P28062	276 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	DUSP1	P28562	367 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	HAAO	P46952	286 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	GNG3	P63215	75 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF616	Q08AN1	781 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	ACSM6	Q6P461	480 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR52J3	Q8NH60	311 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	FANK1	Q8TC84	345 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	FUZ	Q9BT04	418 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	ABHD6	Q9BV23	337 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMED9	Q9BVK6	235 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR10A2	Q9H208	303 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	RASL12	Q9NYN1	266 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	PKD1	P98161	4303 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A087WW49	117 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651		G3V318	75 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651		H3BUI4	141 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651		M0QZK8	103 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	PSMD9	O00233	223 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	ARPC3	O15145	178 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGHG4	P01861	327 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	ELANE	P08246	267 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR8U8	P0C7N1	319 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	HSD11B1	P28845	292 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	ERVK11-1	P61568	191 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	VSNL1	P62760	191 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	FGD3	Q5JSP0	725 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR8H2	Q8N162	312 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651		Q8N9W7	124 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651		U3KQV3	271 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A1W2PPE3	182 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM120B	A0PK00	339 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NIF3L1-206	ENST00000416651	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
NIF3L1-206	ENST00000416651	AP4M1	O00189	453 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NIF3L1-206	ENST00000416651	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF682	O95780	498 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM106CP	P0CH98	169 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NIF3L1-206	ENST00000416651	OPRL1	P41146	370 aa		6.58	□□□□□ -1.36

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