RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368358.3

HCN3-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN3, Length 3,718 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3-201ENST00000368358 V9GYS6 101 aa11.5□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 NBEAQ8NFP9 2946 aa11.5□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 ZNF735P0CB33 412 aa11.5□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 PRKACAP17612 351 aa11.5□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 FUT6P51993 359 aa11.5□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 HERV-K104P61576 105 aa11.5□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 FAM74A1Q5RGS3 127 aa11.5□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 C5orf24Q7Z6I8 188 aa11.5□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 DHRS7CA6NNS2 312 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 MCRIP1C9JLW8 97 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 CASP6P55212 293 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 COMMD7Q86VX2 200 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 SLC25A40Q8TBP6 338 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 SCGB3A2Q96PL1 93 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 SULT4A1Q9BR01 284 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 TRAV39A0A0B4J263 110 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 FAM90A27PA6NNH2 459 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 PPP1CBP62140 327 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 PDZK1IP1Q13113 114 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 GPR137Q96N19 417 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 LINC00470Q9BZP3 86 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 BCL2L14Q9BZR8 327 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 OR14I1A6ND48 311 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 IGHG3P01860 377 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 CCL1P22362 96 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 CTSSP25774 331 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 GLP1RP43220 463 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 RBPJQ06330 500 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 C1orf185Q5T7R7 199 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 Q6ZT83 130 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 GPHA2Q96T91 129 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 TREM2Q9NZC2 230 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 MBD2Q9UBB5 411 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 CLCF1Q9UBD9 225 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 IL36RNQ9UBH0 155 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 GHRLQ9UBU3 117 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 MYO18BQ8IUG5 2567 aa11.49□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 MFNGO00587 321 aa11.48□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 BCL3P20749 454 aa11.48□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 FCGR2CP31995 323 aa11.48□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 PTGER4P35408 488 aa11.48□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 PRDM14Q9GZV8 571 aa11.48□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 SERPINE3A8MV23 424 aa11.48□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 LILRA1O75019 489 aa11.48□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 CBX5P45973 191 aa11.48□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 OR5AP2Q8NGF4 316 aa11.48□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 OR13G1Q8NGZ3 307 aa11.48□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 SECTM1Q8WVN6 248 aa11.48□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 K7ENP7 123 aa11.48□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 CD74P04233 296 aa11.48□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 LUMP51884 338 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 ELP2Q6IA86 826 aa11.48□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 SGPP2Q8IWX5 399 aa11.48□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 WDR13Q9H1Z4 485 aa11.48□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 GLRX2Q9NS18 164 aa11.48□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 B3GNT2Q9NY97 397 aa11.48□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa11.47□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 HSPA12AO43301 675 aa11.47□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 TPPPO94811 219 aa11.47□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 ALX3O95076 343 aa11.47□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 IGKV1D-12P01611 117 aa11.47□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 CRYAAP02489 173 aa11.47□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa11.47□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 IGF2-ASQ6U949 168 aa11.47□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 SLC25A42Q86VD7 318 aa11.47□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 S100PBPQ96BU1 408 aa11.47□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 SMIM3Q9BZL3 60 aa11.47□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa11.47□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 A0A0B4J2A0 478 aa11.47□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa11.47□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 TMEM128Q5BJH2 165 aa11.47□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 CLEC18BQ6UXF7 455 aa11.47□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 OR6K3Q8NGY3 331 aa11.47□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 SYT3Q9BQG1 590 aa11.47□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 SHPKQ9UHJ6 478 aa11.47□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 SYNGR1O43759 233 aa11.47□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 ARL6IP1Q15041 203 aa11.47□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 OR8G1Q15617 311 aa11.47□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 ZNF529Q6P280 563 aa11.47□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 IGFL2Q6UWQ7 119 aa11.47□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 BEND4Q6ZU67 534 aa11.47□□□□□ -0.57
HCN3-201ENST00000368358 LYPD6Q86Y78 171 aa11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms