RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478914.1

XRCC6-208, Transcript of X-ray repair cross complementing 6, humanhuman

TSL 2

Gene XRCC6, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC6-208ENST00000478914 USE1Q9NZ43 259 aa7.15□□□□□ -1.26
XRCC6-208ENST00000478914 OAZ3Q9UMX2 235 aa7.15□□□□□ -1.26
XRCC6-208ENST00000478914 SLC22A13Q9Y226 551 aa7.15□□□□□ -1.26
XRCC6-208ENST00000478914 A0A1B0GTI1 187 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 A6NIN4 97 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 SAC3D1A6NKF1 404 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 H3BSH0 61 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 H3BUX3 64 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 SULT1C4O75897 302 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 APOL3O95236 402 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 CYB5AP00167 134 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 CCL1P22362 96 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 MPZP25189 248 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 ERVFRD-1P60508 538 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 IL24Q13007 206 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 SSX6Q7RTT6 188 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 CATSPERDQ86XM0 798 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 MKXQ8IYA7 352 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 BATF2Q8N1L9 274 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 CD177Q8N6Q3 437 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 BEND2Q8NDZ0 799 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 OR4M1Q8NGD0 313 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 LINC01006Q8NI28 216 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 TNFRSF14Q92956 283 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 UBE2FQ969M7 185 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 BORCS8Q96FH0 119 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 SSX3Q99909 188 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 NRIP2Q9BQI9 281 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 GABARAPL3Q9BY60 117 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 PPA2Q9H2U2 334 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 C16orf95Q9H693 158 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 TCF7L1Q9HCS4 588 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 RAB18Q9NP72 206 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 GNG8Q9UK08 70 aa7.14□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa7.13□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 SNTNA6NMZ2 147 aa7.13□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 CLPXO76031 633 aa7.13□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 TK1P04183 234 aa7.13□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 CHRM2P08172 466 aa7.13□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 OCM2P0CE71 109 aa7.13□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 PIPP12273 146 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 FUT6P51993 359 aa7.13□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 EDDM3BP56851 147 aa7.13□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa7.13□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 TMEM200BQ69YZ2 307 aa7.13□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 Q6ZSR3 168 aa7.13□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 Q6ZSV7 163 aa7.13□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 GDPD3Q7L5L3 318 aa7.13□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 ANGPTL5Q86XS5 388 aa7.13□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 CALHM1Q8IU99 346 aa7.13□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 Q8IYB0 196 aa7.13□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 DTX3Q8N9I9 347 aa7.13□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 PP6455Q8WZ26 134 aa7.13□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 RORBQ92753 470 aa7.13□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 EME1Q96AY2 570 aa7.13□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 C10orf35Q96D05 121 aa7.13□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 CEP19Q96LK0 163 aa7.13□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 CHST5Q9GZS9 411 aa7.13□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 HES4Q9HCC6 221 aa7.13□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.12□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 DAPL1A0PJW8 107 aa7.12□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 K7N7A8 449 aa7.12□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 TSPAN9O75954 239 aa7.12□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 INMTO95050 263 aa7.12□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 CCL3L1P16619 93 aa7.12□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 ZNF20P17024 532 aa7.12□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 COX7A1P24310 79 aa7.12□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 GABRA5P31644 462 aa7.12□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 RBP2P50120 134 aa7.12□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 ATP1B3P54709 279 aa7.12□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 PROK1P58294 105 aa7.12□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 ACTC1P68032 377 aa7.12□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 ACTA1P68133 377 aa7.12□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 COL10A1Q03692 680 aa7.12□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 LY6EQ16553 131 aa7.12□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 TP53I3Q53FA7 332 aa7.12□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 TMEM244Q5VVB8 128 aa7.12□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 MEDAGQ5VYS4 303 aa7.12□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 HCP5Q6MZN7 132 aa7.12□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 SLC25A26Q70HW3 274 aa7.12□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa7.12□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 EGFL6Q8IUX8 553 aa7.12□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 C10orf67Q8IYJ2 551 aa7.12□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 ENTHD1Q8IYW4 607 aa7.12□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 OR4C13Q8NGP0 309 aa7.12□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 OR13D1Q8NGV5 346 aa7.12□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
XRCC6-208ENST00000478914 PYDC1Q8WXC3 89 aa7.12□□□□□ -1.27
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