RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220772.7

SFRP1-201, Transcript of secreted frizzled related protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP1, Length 4,492 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1-201ENST00000220772 GAB2Q9UQC2 676 aa14.62□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 FAM96BQ9Y3D0 163 aa14.62□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 ARGFXA6NJG6 315 aa14.62□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 CFDP00746 253 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 FCARP24071 287 aa14.62□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 FOXL2P58012 376 aa14.62□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 PLGLAQ15195 96 aa14.62□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 AMELYQ99218 206 aa14.62□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 GPR31O00270 319 aa14.62□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 PIN1P1O15428 100 aa14.62□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 HLA-HP01893 362 aa14.62□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 RAB1AP62820 205 aa14.62□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 GGNBP1Q5YKI7 109 aa14.62□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa14.62□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 OR1J1Q8NGS3 322 aa14.62□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 C19orf12Q9NSK7 152 aa14.62□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 PRR13Q9NZ81 148 aa14.62□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 GPR160Q9UJ42 338 aa14.62□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 MPPED1O15442 326 aa14.61□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 MBTPS2O43462 519 aa14.61□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 GPM6AP51674 278 aa14.61□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 DHODHQ02127 395 aa14.61□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 VASH2Q86V25 355 aa14.61□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa14.61□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 RAB39BQ96DA2 213 aa14.61□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 SLC25A38Q96DW6 304 aa14.61□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 MMP26Q9NRE1 261 aa14.61□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 SDK2Q58EX2 2172 aa14.61□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 C4orf47A7E2U8 309 aa14.61□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 ZNF727A8MUV8 499 aa14.61□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 GUK1Q16774 197 aa14.61□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 MIDNQ504T8 468 aa14.61□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 SLC25A42Q86VD7 318 aa14.61□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 BVESQ8NE79 360 aa14.61□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 RPS4Y2Q8TD47 263 aa14.61□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 WNT16Q9UBV4 365 aa14.61□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 SCN4AP35499 1836 aa14.61□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 H7BYZ3 331 aa14.61□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 SFTA3P0C7M3 94 aa14.61□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 ASCL1P50553 236 aa14.61□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 CLEC18BQ6UXF7 455 aa14.61□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 LINC00518Q8N0U6 118 aa14.61□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 ZNF721Q8TF20 911 aa14.61□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 CTHRC1Q96CG8 243 aa14.61□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 UHRF2Q96PU4 802 aa14.61□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.61□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 NFYBP25208 207 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 LIMK1P53667 647 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 OR11L1Q8NGX0 322 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 P4HTMQ9NXG6 502 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 TMED3Q9Y3Q3 217 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 OTOFQ9HC10 1997 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 RAB27BO00194 218 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 THY1P04216 161 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 FAM181AQ8N9Y4 354 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 OR11H4Q8NGC9 324 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 OR2I1PQ8NGU4 316 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 FBXL17Q9UF56 701 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 ZNF391Q9UJN7 358 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 CYB5BO43169 146 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 PDCD6O75340 191 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 VSIG10L2P0DP72 767 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 GSK3AP49840 483 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 MEOX2P50222 304 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 SPATA46Q5T0L3 261 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 FHL5Q5TD97 284 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 UBALD2Q8IYN6 164 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 C1orf87Q8N0U7 546 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 HPSE2Q8WWQ2 592 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 MARVELD3Q96A59 401 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 PIK3IP1Q96FE7 263 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 GREB1Q4ZG55 1949 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 CTSBP07858 339 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 PTAFRP25105 342 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 ACER2Q5QJU3 275 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 TECTBQ96PL2 329 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 UCK1Q9HA47 277 aa14.6□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa14.59□□□□□ -0.07
SFRP1-201ENST00000220772 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms