RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516032.1

RNU6-1334P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1334, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1334P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RDH5Q92781 318 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TCEAL4Q96EI5 215 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 BTF3L4Q96K17 158 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 FAAP24Q9BTP7 215 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 OR11A1Q9GZK7 315 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TMEM100Q9NV29 134 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TREM2Q9NZC2 230 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ARHGEF10O15013 1369 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ADAMTS20P59510 1910 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 OR11H12B2RN74 326 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 C12orf77C9JDV5 145 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RP2O75695 350 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 S1PR2O95136 353 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GIPP09681 153 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TFPTP0C1Z6 253 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LINC00614P0C842 121 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MYL12AP19105 171 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 AK4P27144 223 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CHRNB4P30926 498 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MYCNOSP40205 109 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RPS9P46781 194 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PROK1P58294 105 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CACNG7P62955 275 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PLP2Q04941 152 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RSU1Q15404 277 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SHHQ15465 462 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TSNQ15631 228 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NDUFA5Q16718 116 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LRRC26Q2I0M4 334 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KIAA1644Q3SXP7 199 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 OR10K2Q6IF99 312 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 UFSP1Q6NVU6 142 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CYHR1Q6ZMK1 362 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MRGPRGQ86SM5 289 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GGNQ86UU5 652 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 UBALD2Q8IYN6 164 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 C6orf223Q8N319 242 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 WDSUB1Q8N9V3 476 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CHST4Q8NCG5 386 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 OR11H1Q8NG94 326 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 OR2A12Q8NGT7 310 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 OR11H2Q8NH07 326 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 C16orf52Q8NHV5 167 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 YIPF5Q969M3 257 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CLDN23Q96B33 292 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PRAC1Q96KF2 57 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 FAM210BQ96KR6 192 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MOB1AQ9H8S9 216 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ENY2Q9NPA8 101 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MIEF1Q9NQG6 463 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SLC22A7Q9Y694 548 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RFX7Q2KHR2 1363 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TRIM49D1C9J1S8 452 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LINC01619G3V211 115 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 C16orf97H3BN30 126 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 J3QT63 122 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 M0QZK8 103 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 UPK1BO75841 260 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RENP00797 406 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 IFNA1P01562 189 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 IGHG1P01857 330 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PPBPP02775 128 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 HPNP05981 417 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CRHP06850 196 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 H2AFZP0C0S5 128 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 WARSP23381 471 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PSMB9P28065 219 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CD38P28907 300 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 BTCP35070 178 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GGT2P36268 569 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GABRA4P48169 554 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TAS2R43P59537 309 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ERVFC1-1P60608 527 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PFN3P60673 137 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SNAP25P60880 206 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 GNG3P63215 75 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 BAXQ07812 192 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SLC10A1Q14973 349 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TMEM215Q68D42 235 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KCTD16Q68DU8 428 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PPP1R27Q86WC6 154 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.3 ms