RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561524.5

KIFC3-208, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 577 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-208	ENST00000561524	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		13.85	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	C3orf80	F5H4A9	247 aa		13.84	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	ADAM20	O43506	726 aa		13.84	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	SELENOF	O60613	162 aa		13.84	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	ATP5H	O75947	161 aa		13.84	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	CST4	P01036	141 aa		13.84	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		13.84	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	DCTD	P32321	178 aa		13.84	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	GNAL	P38405	381 aa		13.84	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	IL5RA	Q01344	420 aa		13.84	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	SNAPC1	Q16533	368 aa		13.84	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		13.84	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		13.84	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	ITPKC	Q96DU7	683 aa		13.84	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		13.84	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		13.84	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		13.84	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		13.84	□□□□□ -0.19
KIFC3-208	ENST00000561524	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		13.83	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	TMEM210	A6NLX4	147 aa		13.83	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		13.83	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	C22orf46	C9J442	243 aa		13.83	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF254	O75437	659 aa		13.83	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	HKR1	P10072	659 aa		13.83	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	FOXL1	Q12952	345 aa		13.83	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	MICB	Q29980	383 aa		13.83	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		13.83	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	WDR82	Q6UXN9	313 aa		13.83	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	WDR86	Q86TI4	376 aa		13.83	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		13.83	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	C3orf56	Q8N813	242 aa		13.83	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		13.83	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	TECTB	Q96PL2	329 aa		13.83	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	MICU1	Q9BPX6	476 aa		13.83	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	BRD7	Q9NPI1	651 aa		13.83	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		13.83	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		13.83	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		13.83	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	LRP12	Q9Y561	859 aa		13.83	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		13.83	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		13.82	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524		A0A0U1RQV5	110 aa		13.82	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		13.82	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	SRRM5	B3KS81	715 aa		13.82	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF879	B4DU55	563 aa		13.82	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	P2RY10	O00398	339 aa		13.82	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	GPR37	O15354	613 aa		13.82	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	ATP6V1B1	P15313	513 aa		13.82	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	DAP	P51397	102 aa		13.82	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	ROM1	Q03395	351 aa		13.82	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	BAMBI	Q13145	260 aa		13.82	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	APOF	Q13790	326 aa		13.82	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		13.82	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	KRT77	Q7Z794	578 aa		13.82	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		13.82	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		13.82	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		13.82	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		13.82	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	MRO	Q9BYG7	248 aa		13.82	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	GYPA	P02724	150 aa		13.81	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	ACKR3	P25106	362 aa		13.81	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	FGF12	P61328	243 aa		13.81	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	EFNB1	P98172	346 aa		13.81	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	ATP6AP1	Q15904	470 aa		13.81	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		13.81	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	AWAT1	Q58HT5	328 aa		13.81	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	GPR157	Q5UAW9	335 aa		13.81	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		13.81	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	LRRC29	Q8WV35	223 aa		13.81	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		13.81	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	SLC25A28	Q96A46	364 aa		13.81	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	LYZL4	Q96KX0	146 aa		13.81	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		13.81	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		13.81	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		13.81	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		13.81	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	CCDC182	A6NF36	153 aa		13.8	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524		G3V2T6	193 aa		13.8	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	DVL1	O14640	695 aa		13.8	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	TMPRSS2	O15393	492 aa		13.8	□□□□□ -0.2
KIFC3-208	ENST00000561524	MMP9	P14780	707 aa		13.8	□□□□□ -0.2

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